195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2554 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  100 
 
 		 469 aa  959    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  50.59 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  52.67 
 
 		 473 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  51.41 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  50.59 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  48.75 
 
 		 467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  47.95 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  47.31 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  46.88 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  46.79 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  49.65 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  48.72 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  46.02 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  48.48 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  48.72 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  48.25 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  46.73 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  44.68 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  49.01 
 
 		 414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  44.11 
 
 		 471 aa  335  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  41.89 
 
 		 457 aa  332  9e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  43.39 
 
 		 468 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  44.92 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  37.45 
 
 		 495 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  38.89 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  33.33 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  34.62 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  30.99 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  31.32 
 
 		 460 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  31.79 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  31.46 
 
 		 580 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  28.66 
 
 		 526 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.31 
 
 		 525 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.35 
 
 		 497 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  27.02 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  25.59 
 
 		 578 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  24.44 
 
 		 539 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  29.22 
 
 		 552 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  26.12 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  25.05 
 
 		 544 aa  93.2  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  26.43 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  28.2 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  24.27 
 
 		 698 aa  73.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  24.91 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  27.29 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  23.61 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  25.34 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  30.89 
 
 		 677 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  23.38 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  24.32 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  24.11 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  33.58 
 
 		 547 aa  63.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  24.11 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  24.11 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  29.43 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  33.04 
 
 		 559 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  33.08 
 
 		 550 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  23.9 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  37.39 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  23.9 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  23.9 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  26.29 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  27.87 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  23.89 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  33.71 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  26.13 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  27.67 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  37.76 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  24.25 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  23.68 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  38.1 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  37.61 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  25 
 
 		 436 aa  57  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.2 
 
 		 539 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  26.71 
 
 		 884 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  32.11 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  32.11 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  34.02 
 
 		 504 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  30.89 
 
 		 575 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  32.11 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  26.76 
 
 		 319 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  31.29 
 
 		 373 aa  53.9  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  27.42 
 
 		 523 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  31.21 
 
 		 725 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.22 
 
 		 545 aa  53.9  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  37.5 
 
 		 678 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  25.09 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  33.33 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  32.38 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  27.17 
 
 		 549 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  37.86 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  37.86 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  22.33 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  23.2 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  37.86 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  37.86 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  37.86 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  37.86 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  33.59 
 
 		 512 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  35.87 
 
 		 947 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>