232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3539 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  85.75 
 
 		 468 aa  741    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  85.75 
 
 		 468 aa  743    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  100 
 
 		 414 aa  840    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  91.06 
 
 		 468 aa  786    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  85.51 
 
 		 468 aa  742    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  91.3 
 
 		 468 aa  788    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  73.91 
 
 		 481 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  92.27 
 
 		 468 aa  795    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  85.51 
 
 		 468 aa  736    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  86.96 
 
 		 469 aa  746    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  74.08 
 
 		 466 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  73.9 
 
 		 481 aa  626  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  73.59 
 
 		 477 aa  625  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  70.17 
 
 		 467 aa  594  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  74.64 
 
 		 468 aa  594  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  58.33 
 
 		 472 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  50.61 
 
 		 473 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  49.01 
 
 		 469 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  48.15 
 
 		 471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  47.3 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  45.83 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  42.12 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  42.08 
 
 		 457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  39.51 
 
 		 472 aa  258  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  39.55 
 
 		 525 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  38.05 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  37.08 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  38.65 
 
 		 495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  37.81 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  37.56 
 
 		 460 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  34.52 
 
 		 580 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  25.97 
 
 		 525 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  26.1 
 
 		 552 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  27.31 
 
 		 497 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  27.69 
 
 		 539 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  26.43 
 
 		 544 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  25.91 
 
 		 526 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  25.77 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.16 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  25.64 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  25.99 
 
 		 698 aa  76.6  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  26.06 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  23.46 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  27.93 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  27.65 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  31.22 
 
 		 512 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  22.58 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  29.59 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  28.39 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  27.27 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  28.43 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  29.1 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  38.78 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  39.08 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  24.3 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  27.7 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  22.7 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  29.51 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  27.48 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  36.11 
 
 		 559 aa  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  23.27 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  25.71 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  21.56 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  36.54 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  35.51 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  29.25 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  28.57 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  27.35 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  27.33 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  35.96 
 
 		 734 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  38.04 
 
 		 523 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  43 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  39.33 
 
 		 502 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  40.74 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.71 
 
 		 775 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  31.25 
 
 		 757 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  26.36 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  26.78 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  32.3 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  22.81 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  24.23 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  32.3 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  26.37 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  35.87 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  23.93 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  23.93 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  38.04 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  28.95 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  38.89 
 
 		 743 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  23.26 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  24.26 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  23.51 
 
 		 466 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  23.51 
 
 		 466 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  23.51 
 
 		 466 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  23.51 
 
 		 466 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  23.51 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  38.89 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  32.2 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  39.13 
 
 		 529 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  30.52 
 
 		 533 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>