225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1116 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  85.75 
 
 		 414 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  72.9 
 
 		 477 aa  684    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  68.49 
 
 		 481 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  97.65 
 
 		 468 aa  907    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  69.94 
 
 		 466 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  87.61 
 
 		 468 aa  836    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  86.54 
 
 		 468 aa  830    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  69.17 
 
 		 481 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  86.97 
 
 		 468 aa  833    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  97.01 
 
 		 468 aa  900    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  100 
 
 		 468 aa  953    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  97.22 
 
 		 468 aa  905    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  86.3 
 
 		 469 aa  833    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  70.94 
 
 		 468 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  70.86 
 
 		 467 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  55.99 
 
 		 472 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  46.88 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  48.31 
 
 		 473 aa  385  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  48.49 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  48.13 
 
 		 471 aa  341  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  46.25 
 
 		 471 aa  339  7e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  43.83 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  40.49 
 
 		 468 aa  309  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  38.59 
 
 		 525 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  36.2 
 
 		 472 aa  263  6e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  36.15 
 
 		 495 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  35.51 
 
 		 458 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  35.89 
 
 		 454 aa  239  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  33.83 
 
 		 463 aa  232  8.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  35.67 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 580 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  27.88 
 
 		 525 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  24.41 
 
 		 552 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  28.06 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  25.76 
 
 		 578 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  25.92 
 
 		 497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  28.27 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  25.05 
 
 		 526 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.81 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.76 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  28.09 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  26.06 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  26.56 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  32.08 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  28.62 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  27.41 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  29.87 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  29.33 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  29.31 
 
 		 512 aa  67  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  36.63 
 
 		 501 aa  67  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  40.23 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  28.5 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  40.24 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  23.17 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  23.8 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  27.06 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  25.84 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  40 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  23.79 
 
 		 454 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  39.77 
 
 		 678 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  40 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  27.64 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  27 
 
 		 677 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  28.68 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  28.7 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  37.89 
 
 		 550 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  28.57 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  25.31 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  25.45 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  26.36 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  24.59 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  29.12 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  40.74 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  30.93 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  39.56 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  27.23 
 
 		 291 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  30.93 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  31.44 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  24.88 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  30.93 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  24.57 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  30.93 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  22.5 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  43.21 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  35.23 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  30.41 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.91 
 
 		 775 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  26.51 
 
 		 334 aa  57  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  41.98 
 
 		 535 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  28.57 
 
 		 518 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  45.68 
 
 		 512 aa  57  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  41.98 
 
 		 536 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  29.69 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  28.64 
 
 		 947 aa  56.6  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  38.46 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  32.2 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  24.18 
 
 		 466 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  29.17 
 
 		 309 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  22.99 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  38.89 
 
 		 743 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>