215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1286 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  100 
 
 		 466 aa  947    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  75.7 
 
 		 477 aa  740    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  69.94 
 
 		 468 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  67.72 
 
 		 481 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  70.6 
 
 		 468 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  72.16 
 
 		 468 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  71.61 
 
 		 468 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  68.14 
 
 		 481 aa  672    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  71.95 
 
 		 468 aa  681    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  69.96 
 
 		 468 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  70.15 
 
 		 468 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  72.96 
 
 		 468 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  71.09 
 
 		 469 aa  679    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  70.78 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  74.08 
 
 		 414 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  56.43 
 
 		 472 aa  514  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  47.95 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  50.69 
 
 		 473 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  48.96 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  47.58 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  48.15 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  42.73 
 
 		 468 aa  333  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  42.01 
 
 		 457 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  40.24 
 
 		 525 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  35.1 
 
 		 472 aa  258  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  37.09 
 
 		 495 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  34.05 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  35.5 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  35.22 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  34.93 
 
 		 580 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  32.61 
 
 		 460 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.88 
 
 		 525 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  24.81 
 
 		 552 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  26.68 
 
 		 539 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  27.17 
 
 		 544 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  25.56 
 
 		 578 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  24.9 
 
 		 526 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  24.89 
 
 		 497 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.72 
 
 		 487 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  26.25 
 
 		 456 aa  87.4  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.08 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  25.06 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  24.37 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  23.91 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  25.72 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  23.74 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  23.58 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  23.58 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  23.58 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  23.58 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  23.58 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  29.7 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  25.25 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  23.85 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  32 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  25 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  23.36 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  25.42 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  23.35 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  26.43 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  36.78 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  30.05 
 
 		 775 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  22.37 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  26.64 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  39.13 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  33.68 
 
 		 734 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  23.57 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  30.3 
 
 		 513 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  26.74 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  37.21 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  29.77 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  33.58 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  24.25 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  26.22 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  36.84 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  23.5 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  29.08 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  37.78 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  34.15 
 
 		 757 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  41.3 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  27.36 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  33.33 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  31.58 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  23.75 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  42.68 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  44.44 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  34.44 
 
 		 501 aa  57  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  31.96 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  26.44 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  31.44 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  26.67 
 
 		 346 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  31.44 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  27.39 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  32.12 
 
 		 522 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  35.92 
 
 		 519 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  38.64 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  36.17 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  36.19 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  32.84 
 
 		 558 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  33.67 
 
 		 563 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>