297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4110 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  100 
 
 		 487 aa  1006    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  61.47 
 
 		 497 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  26.56 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  25.34 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  29.48 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  27.92 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  29.22 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  28.38 
 
 		 438 aa  131  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  27.33 
 
 		 454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  25.72 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  28.77 
 
 		 440 aa  127  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  29.78 
 
 		 479 aa  124  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  31.73 
 
 		 454 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  30.08 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  28.83 
 
 		 472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  28.18 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  25.56 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  28.95 
 
 		 539 aa  113  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  26.15 
 
 		 467 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  27.02 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  26.67 
 
 		 580 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  25.81 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  29.14 
 
 		 481 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  26.74 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  26.71 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  25.46 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  25.86 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  26.01 
 
 		 468 aa  100  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  29.06 
 
 		 525 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  25.93 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  24.88 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  28.88 
 
 		 391 aa  97.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  25.28 
 
 		 469 aa  96.7  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  28.97 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  28.86 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  25.93 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  25.81 
 
 		 468 aa  93.2  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  25.2 
 
 		 481 aa  93.2  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  25.46 
 
 		 468 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  26.16 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  25.81 
 
 		 468 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  26.1 
 
 		 552 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  26.07 
 
 		 468 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  26.77 
 
 		 477 aa  90.1  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  26.87 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  25.72 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  25.96 
 
 		 544 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  25.78 
 
 		 481 aa  86.7  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  25.8 
 
 		 515 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  28.22 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  29.62 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.74 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  28.51 
 
 		 947 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  27.79 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  27.18 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  27.18 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  27.18 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  25.81 
 
 		 512 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  27.85 
 
 		 559 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  27.25 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  30.1 
 
 		 775 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  27.67 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  27.18 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  27.18 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  23.95 
 
 		 944 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  25.12 
 
 		 678 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  26.98 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  27.7 
 
 		 518 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  30.23 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  30.23 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  29.91 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  30.23 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  28.67 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.09 
 
 		 555 aa  78.2  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  27.15 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  25.55 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  30.65 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  25.48 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  25.36 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  23.19 
 
 		 525 aa  76.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  25.13 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  28.76 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  27.78 
 
 		 1077 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  30.04 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  28.15 
 
 		 569 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  25.08 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  29.36 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  26.11 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  27.15 
 
 		 1147 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  29.31 
 
 		 557 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  29.61 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  29.61 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  29.61 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30.5 
 
 		 598 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.61 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  28.88 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  27.31 
 
 		 552 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  30.33 
 
 		 534 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  29.18 
 
 		 558 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  26.7 
 
 		 550 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>