186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3182 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  100 
 
 		 472 aa  969    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  56.43 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  58.24 
 
 		 481 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  56.33 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  55.29 
 
 		 468 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  55.77 
 
 		 468 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  52.41 
 
 		 481 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  55.72 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  56.98 
 
 		 468 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  57.53 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  55.05 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  56.98 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  56.76 
 
 		 468 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  52.93 
 
 		 467 aa  480  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  56.67 
 
 		 468 aa  478  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  58.33 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  50.59 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  49.31 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  48.36 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  42.86 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  44.4 
 
 		 471 aa  338  9e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  42.12 
 
 		 468 aa  323  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  41.69 
 
 		 457 aa  315  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  39.39 
 
 		 525 aa  274  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  36.67 
 
 		 495 aa  247  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  35.04 
 
 		 472 aa  246  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  34.63 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  33.94 
 
 		 463 aa  223  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  35.36 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  34.34 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 580 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  27.29 
 
 		 526 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  31.45 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.6 
 
 		 497 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  24.85 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  23.74 
 
 		 578 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  21.7 
 
 		 552 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  25.91 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  26.34 
 
 		 454 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  25.42 
 
 		 544 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  28.97 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  26.62 
 
 		 456 aa  86.7  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  26.99 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  26.23 
 
 		 698 aa  83.2  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  31.12 
 
 		 677 aa  77  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  24.13 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  27.18 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  23.58 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  27.83 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  23.94 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  28.57 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  22.35 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  30.29 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  22.94 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  22.81 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  22.78 
 
 		 466 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  25.75 
 
 		 488 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  22.77 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  22.8 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  31.16 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  22.78 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  29.25 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  22.78 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  23.58 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  22.78 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  33.96 
 
 		 734 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  24.08 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  24.08 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  22.78 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  32.84 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  28.77 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  40 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  33.33 
 
 		 725 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  37.11 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  29.59 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  28.33 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  29.59 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  24.76 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  29.59 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  29.59 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  29.59 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  29.08 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  29.59 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  37.86 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  24.63 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  25.25 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  25.66 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  24.6 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.19 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  28.07 
 
 		 500 aa  57  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  32.38 
 
 		 884 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  24.76 
 
 		 757 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  28.8 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  28.8 
 
 		 417 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  28.64 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  35.09 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  37.08 
 
 		 559 aa  55.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  34.38 
 
 		 629 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  28.27 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  28.27 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>