277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2848 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  100 
 
 		 526 aa  1085    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  31.95 
 
 		 544 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  30.35 
 
 		 525 aa  200  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  29.23 
 
 		 539 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  29.12 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  27.31 
 
 		 578 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  29.4 
 
 		 525 aa  156  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  28.39 
 
 		 495 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  29.31 
 
 		 473 aa  129  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  28.66 
 
 		 469 aa  127  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  27.29 
 
 		 472 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  28.7 
 
 		 468 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  23.98 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  24.84 
 
 		 467 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  25.94 
 
 		 468 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  23.98 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  25 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  24.47 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  26.37 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  24.56 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  27.68 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  25.05 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  26 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  24.56 
 
 		 468 aa  107  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  25 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  25.21 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  26.52 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  24.9 
 
 		 466 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  24.31 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  25.68 
 
 		 414 aa  97.4  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  23.4 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  25.37 
 
 		 472 aa  88.6  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  26.35 
 
 		 454 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  26.79 
 
 		 580 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  26.65 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  27.3 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  25.5 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  24.82 
 
 		 725 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  28.16 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.83 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  29.51 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  30.73 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  27.87 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  24.36 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  27.84 
 
 		 884 aa  71.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  27.47 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  28.26 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  33.58 
 
 		 678 aa  70.5  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  23.23 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  29.17 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  33.87 
 
 		 734 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  26.12 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  25.84 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  30.62 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  34.43 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  32.18 
 
 		 772 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  39.45 
 
 		 334 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  29.71 
 
 		 757 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.02 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  25.91 
 
 		 751 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  26.94 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  33.14 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  33.88 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  31.25 
 
 		 947 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  32.57 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  36 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  34.55 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  32.45 
 
 		 677 aa  61.6  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  25 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  26.33 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  29.91 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  28.17 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  32.53 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  30.2 
 
 		 591 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  31.15 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  27.57 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  29.54 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  37.76 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  30.83 
 
 		 743 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  37.76 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  28.49 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  28.89 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  28.24 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  32.09 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  38.78 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  29.96 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  32.11 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  29.09 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  31.94 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  28.44 
 
 		 323 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  29.26 
 
 		 552 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  30.36 
 
 		 514 aa  56.6  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  28.57 
 
 		 548 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  30.05 
 
 		 546 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  29.26 
 
 		 552 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  28.5 
 
 		 503 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  32.39 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  32.39 
 
 		 501 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  39.76 
 
 		 524 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  32.39 
 
 		 501 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>