216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0653 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  100 
 
 
438 aa  877    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  65.15 
 
 
440 aa  551  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  60.79 
 
 
454 aa  529  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  63.1 
 
 
436 aa  527  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  46.91 
 
 
456 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  46.82 
 
 
440 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  48.99 
 
 
447 aa  347  2e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  45.23 
 
 
454 aa  343  4e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  41.65 
 
 
459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  40.97 
 
 
479 aa  301  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  29.17 
 
 
497 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  28.38 
 
 
487 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  26.17 
 
 
463 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  28.22 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  26.93 
 
 
512 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  28.11 
 
 
525 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  30.03 
 
 
548 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  30.41 
 
 
584 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  23.81 
 
 
571 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  25.78 
 
 
495 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  25.4 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  26.28 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  27.87 
 
 
526 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  27.4 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.96 
 
 
944 aa  73.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  27.85 
 
 
534 aa  73.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  25.61 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  25.61 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  26.01 
 
 
466 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  28.1 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  29.02 
 
 
503 aa  70.1  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  25.3 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  26.44 
 
 
454 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  26.75 
 
 
458 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  25.3 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  26.84 
 
 
500 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  25.37 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  25.3 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  25.11 
 
 
529 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  24.76 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  25.3 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  23.64 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  24.77 
 
 
460 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  30.99 
 
 
552 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  25.37 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  23.36 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  30.88 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  22.94 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  28.7 
 
 
512 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  27.03 
 
 
552 aa  67  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  31.44 
 
 
557 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  30.67 
 
 
558 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  37.01 
 
 
512 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  25.5 
 
 
466 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.28 
 
 
775 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  27.87 
 
 
1077 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.73 
 
 
598 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  30.26 
 
 
522 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  22.27 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  23.11 
 
 
468 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  25.28 
 
 
465 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  23.35 
 
 
462 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  31.44 
 
 
557 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  30.22 
 
 
558 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  25.49 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  24.16 
 
 
468 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  23.8 
 
 
468 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  23.88 
 
 
468 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  26.51 
 
 
1147 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  32.43 
 
 
556 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  22.48 
 
 
469 aa  63.9  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  30.14 
 
 
515 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  30.85 
 
 
558 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  30.85 
 
 
558 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  22.83 
 
 
552 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  31.44 
 
 
557 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  23.06 
 
 
481 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  23.57 
 
 
466 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  24.64 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  29.74 
 
 
312 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  30 
 
 
547 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  24.5 
 
 
457 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  27.27 
 
 
1247 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  28.79 
 
 
947 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  26.42 
 
 
514 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  25.09 
 
 
698 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  26.85 
 
 
510 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  27.27 
 
 
518 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  23.79 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  32.57 
 
 
512 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  23.1 
 
 
472 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  22.78 
 
 
539 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  28.1 
 
 
457 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  23.11 
 
 
481 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  30.27 
 
 
552 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  29.26 
 
 
557 aa  57.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  26.94 
 
 
552 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  31.41 
 
 
553 aa  57.4  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  26.1 
 
 
481 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  28.14 
 
 
391 aa  57  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>