107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3518 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  100 
 
 
463 aa  955    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  62.85 
 
 
472 aa  591  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  56.93 
 
 
460 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  57.21 
 
 
454 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  47.94 
 
 
458 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  42.66 
 
 
580 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  36.26 
 
 
525 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  35.32 
 
 
469 aa  249  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  36.53 
 
 
495 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  34.48 
 
 
468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  34.48 
 
 
468 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  35.21 
 
 
477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  34.48 
 
 
468 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  34.05 
 
 
466 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  34.31 
 
 
481 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  35.44 
 
 
468 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  35.73 
 
 
468 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  35.5 
 
 
468 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  37.08 
 
 
414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  34.86 
 
 
468 aa  226  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  33.48 
 
 
481 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  35.27 
 
 
468 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  33.94 
 
 
472 aa  223  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  32.53 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  32.89 
 
 
467 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  30.99 
 
 
469 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  33.18 
 
 
473 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  32.72 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  29.67 
 
 
471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  30.65 
 
 
471 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  26.81 
 
 
457 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  27.69 
 
 
497 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.71 
 
 
487 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  26.41 
 
 
578 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.67 
 
 
525 aa  77  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  40.48 
 
 
552 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  24.29 
 
 
539 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  25.9 
 
 
456 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  26.42 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  27.47 
 
 
526 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  23.36 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  25.79 
 
 
544 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  30.51 
 
 
483 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  25.06 
 
 
462 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  25.4 
 
 
466 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  27.52 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  25.23 
 
 
678 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  30 
 
 
512 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  30.32 
 
 
727 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  25.79 
 
 
501 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  25.4 
 
 
465 aa  57.4  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  25.46 
 
 
466 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  26.91 
 
 
466 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  26.91 
 
 
466 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  25.79 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  25.08 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  26.91 
 
 
466 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  26.91 
 
 
466 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  25.08 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  26.91 
 
 
466 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  23.75 
 
 
459 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  24.17 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  24.17 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  24.77 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  26.12 
 
 
479 aa  54.7  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  26.78 
 
 
504 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  25.43 
 
 
551 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  29.46 
 
 
677 aa  53.5  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  24.47 
 
 
523 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  23.93 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  27.1 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  26.45 
 
 
408 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  26.45 
 
 
408 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  33.33 
 
 
725 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  25.29 
 
 
454 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  26.45 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  26.45 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  26.45 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  30.77 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  22.92 
 
 
463 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  26.45 
 
 
408 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  26.45 
 
 
384 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  32.63 
 
 
884 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  38.24 
 
 
335 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  22.41 
 
 
454 aa  50.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  30.28 
 
 
757 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  23.16 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  23.16 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  27.97 
 
 
734 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  27.33 
 
 
533 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  31.29 
 
 
534 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  31.25 
 
 
751 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  28.36 
 
 
512 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04080  peptidase, putative  40.98 
 
 
402 aa  47  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  24.36 
 
 
533 aa  47  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  26.58 
 
 
513 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  33.33 
 
 
347 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  22.22 
 
 
698 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  23.86 
 
 
794 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  31.88 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>