212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89245 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  100 
 
 
533 aa  1099    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  53.51 
 
 
502 aa  512  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  40.78 
 
 
503 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  37.79 
 
 
518 aa  266  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  43.14 
 
 
515 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  35.14 
 
 
513 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  39.37 
 
 
548 aa  251  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  41.08 
 
 
509 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  41.1 
 
 
555 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  39.55 
 
 
506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  39.62 
 
 
512 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  33.98 
 
 
512 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  34.27 
 
 
512 aa  231  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  36 
 
 
536 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  35.76 
 
 
535 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  36.3 
 
 
481 aa  221  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  39.22 
 
 
514 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  35.75 
 
 
501 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  36.3 
 
 
500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  35.75 
 
 
501 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  35.75 
 
 
501 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  37.35 
 
 
512 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  35.85 
 
 
512 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  34.84 
 
 
502 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  34.68 
 
 
510 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  35.18 
 
 
524 aa  204  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  46.9 
 
 
519 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  46.02 
 
 
518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  36.7 
 
 
534 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  43.48 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  31.11 
 
 
479 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  31.56 
 
 
488 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  31.42 
 
 
479 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  31.42 
 
 
479 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  42.99 
 
 
312 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  30.95 
 
 
488 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  39.13 
 
 
1077 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  38.7 
 
 
1147 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  41.43 
 
 
947 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  43.07 
 
 
1131 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  38.57 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  38.34 
 
 
437 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  32.56 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  36.32 
 
 
309 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  32.98 
 
 
466 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  32.98 
 
 
466 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  32.98 
 
 
466 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  32.63 
 
 
466 aa  100  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  32.63 
 
 
466 aa  100  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  32.63 
 
 
466 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  32.63 
 
 
466 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  27.85 
 
 
391 aa  95.5  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  31.4 
 
 
466 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  31.06 
 
 
466 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  29.63 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  29.93 
 
 
466 aa  92  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  29.68 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  26.95 
 
 
584 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  27.7 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  26.46 
 
 
571 aa  74.7  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  34.44 
 
 
338 aa  73.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  26.73 
 
 
457 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  30.81 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  32.93 
 
 
1247 aa  69.3  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  30.04 
 
 
563 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  29.56 
 
 
559 aa  68.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  24.73 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  32.77 
 
 
539 aa  66.6  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  27.27 
 
 
323 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  24.57 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  36 
 
 
468 aa  62.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  22.81 
 
 
497 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  30 
 
 
401 aa  61.6  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  29.89 
 
 
775 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  32.03 
 
 
401 aa  60.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  27.13 
 
 
539 aa  60.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  27.13 
 
 
727 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  26.64 
 
 
440 aa  57.4  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  28.12 
 
 
625 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  31.65 
 
 
481 aa  57  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  26.29 
 
 
552 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  31.82 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  32.28 
 
 
469 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  29.32 
 
 
647 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  28.92 
 
 
526 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  30.04 
 
 
549 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  29.46 
 
 
495 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  28.07 
 
 
550 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  33.07 
 
 
468 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  33.33 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  28.75 
 
 
575 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  26.24 
 
 
463 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  31.45 
 
 
467 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  23.6 
 
 
578 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  24.11 
 
 
462 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  31.17 
 
 
468 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  33.07 
 
 
468 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  29.91 
 
 
333 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  30.52 
 
 
468 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  28.57 
 
 
647 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>