277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2907 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  100 
 
 
463 aa  923    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.59 
 
 
497 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.34 
 
 
487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  27.17 
 
 
495 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  28.81 
 
 
436 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  25.86 
 
 
454 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  26.04 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  26.46 
 
 
440 aa  97.1  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  27.33 
 
 
454 aa  97.1  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  27.7 
 
 
440 aa  94  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  29.28 
 
 
457 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  26.33 
 
 
471 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  24.88 
 
 
467 aa  90.1  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  28.78 
 
 
468 aa  87.4  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  26.51 
 
 
525 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.57 
 
 
775 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  25.9 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  25.49 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  27.17 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  28 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  25 
 
 
479 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  21.78 
 
 
456 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  24.82 
 
 
447 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  27.24 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  25.23 
 
 
468 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  24.92 
 
 
481 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  25.99 
 
 
472 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  23.47 
 
 
466 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  23.84 
 
 
468 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  25.79 
 
 
512 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  25.25 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  23.49 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  25.91 
 
 
481 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  23.7 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  23.35 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  25.41 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  24.46 
 
 
555 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  28.41 
 
 
544 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  23.17 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  25.91 
 
 
512 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  23.54 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  24.94 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  25 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  36.03 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  33.02 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  23.02 
 
 
468 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  30.54 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  23.92 
 
 
491 aa  67.8  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  27.06 
 
 
539 aa  67.4  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  32.88 
 
 
1103 aa  67  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  29.69 
 
 
309 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  24 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  30.48 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  28.92 
 
 
529 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.57 
 
 
674 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  36.96 
 
 
548 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  28.16 
 
 
1147 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  22.02 
 
 
325 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  24.52 
 
 
466 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  24.84 
 
 
477 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  29.11 
 
 
532 aa  64.3  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  24.46 
 
 
466 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  24.46 
 
 
466 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  28.06 
 
 
1077 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  24.33 
 
 
466 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  24.34 
 
 
466 aa  63.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  24.33 
 
 
466 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  24.34 
 
 
466 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  27.08 
 
 
323 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  35.2 
 
 
481 aa  63.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  26.91 
 
 
598 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  24.31 
 
 
539 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  38.52 
 
 
524 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  25.57 
 
 
458 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  28.93 
 
 
490 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.14 
 
 
944 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  22.9 
 
 
552 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  27.27 
 
 
532 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  27.27 
 
 
540 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  22.58 
 
 
414 aa  61.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.71 
 
 
546 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  27.27 
 
 
540 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  23.18 
 
 
465 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  29.61 
 
 
574 aa  60.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  26.72 
 
 
514 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 
580 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.74 
 
 
533 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  25.26 
 
 
512 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  28.87 
 
 
591 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  26.03 
 
 
541 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.38 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.38 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  26.03 
 
 
541 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.37 
 
 
557 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16010  predicted aminopeptidase  36.45 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  hitchhiker  0.000000285922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  28.24 
 
 
526 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  33.33 
 
 
525 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  30.69 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  22.49 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  25.91 
 
 
407 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>