240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3374 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  70.31 
 
 		 591 aa  706    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  67.42 
 
 		 568 aa  684    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  982    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  35.36 
 
 		 430 aa  189  8e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  36.88 
 
 		 512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  30.89 
 
 		 1103 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.29 
 
 		 674 aa  80.1  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.23 
 
 		 574 aa  77  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  27.8 
 
 		 598 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  25.88 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  27.05 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  30.11 
 
 		 440 aa  67  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  27.05 
 
 		 323 aa  67  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  25.61 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  25.11 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  28.09 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.51 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  29.44 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  29.73 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  28.34 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  23.67 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  26.24 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.24 
 
 		 539 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.27 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  23.53 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  33.59 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  33.59 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  26.61 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  23.55 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.91 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  29.49 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  28.25 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  25.4 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  25.79 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  25.89 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  25.31 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.39 
 
 		 944 aa  60.1  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  31.78 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  31.43 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.45 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  25.7 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  28.32 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  24.9 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  30.05 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  30.05 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  25.89 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  23.35 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  31.78 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  31.78 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  32.82 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  32.82 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  22.26 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  31.78 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  31.78 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  27.88 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  33.59 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  26.92 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  23.81 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  23.31 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  40.66 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  26.34 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  29.74 
 
 		 560 aa  58.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  22.88 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  25.81 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  31.39 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  28.48 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3061  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.65 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3126  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.65 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  28.29 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3087  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.65 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3246  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.65 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3142  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.65 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.634375 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  31.61 
 
 		 603 aa  57.4  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.48 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  25.23 
 
 		 532 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  23.67 
 
 		 490 aa  57  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  29.63 
 
 		 549 aa  57  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  30.23 
 
 		 551 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  26.2 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  26.7 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  23.74 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  25.23 
 
 		 540 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4005  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.66 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  25.23 
 
 		 540 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  26.7 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3054  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.22 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.957011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  26.22 
 
 		 558 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  31.54 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  25.36 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  32.84 
 
 		 557 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0935  peptidase M28  30.28 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  24.31 
 
 		 531 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02603  aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion  30.28 
 
 		 345 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  29.02 
 
 		 571 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3121  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.28 
 
 		 345 aa  54.7  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0959  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.28 
 
 		 345 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02568  hypothetical protein  30.28 
 
 		 345 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2891  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.28 
 
 		 345 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.86 
 
 		 347 aa  54.7  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  25.55 
 
 		 537 aa  53.9  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>