279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2164 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  100 
 
 
512 aa  1030    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  31.41 
 
 
591 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  32.75 
 
 
568 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  33 
 
 
430 aa  156  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  36.88 
 
 
476 aa  153  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  36.16 
 
 
1247 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  27.41 
 
 
308 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  29.43 
 
 
347 aa  84  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  33.7 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  28.63 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  35.29 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  29.74 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  36.79 
 
 
1103 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  28.63 
 
 
306 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.54 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  31.82 
 
 
647 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  34.67 
 
 
775 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  31.86 
 
 
440 aa  76.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  25.87 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  23.81 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  34.39 
 
 
647 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  30.15 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.48 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  29.49 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  33.51 
 
 
674 aa  73.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4005  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.38 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.63 
 
 
598 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3054  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.38 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.957011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02603  aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion  29.38 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0935  peptidase M28  29.38 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02568  hypothetical protein  29.38 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0959  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.38 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2891  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.38 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3121  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.38 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  26.14 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  34.69 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2879  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.38 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  34.87 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  27.27 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  34.48 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  32.53 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  36.97 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.21 
 
 
650 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  27.23 
 
 
555 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  30.85 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  33.02 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  36.97 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  36.97 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  36.97 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  32 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  36.97 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  36.97 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  36.36 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  36.36 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  35.76 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  35.76 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  26.64 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.07 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  31.35 
 
 
514 aa  67  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3061  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.38 
 
 
348 aa  67  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3126  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.38 
 
 
348 aa  67  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3142  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.38 
 
 
348 aa  67  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.634375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3246  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.38 
 
 
348 aa  67  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3087  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.38 
 
 
348 aa  67  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  30.05 
 
 
539 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.83 
 
 
574 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.92 
 
 
346 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  31.15 
 
 
454 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  30.21 
 
 
315 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  29.55 
 
 
436 aa  64.7  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  28.74 
 
 
301 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  25.65 
 
 
579 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  29.76 
 
 
338 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  29.8 
 
 
506 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  26.88 
 
 
347 aa  61.6  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  30.32 
 
 
436 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  29.21 
 
 
308 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  33.16 
 
 
584 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  37.23 
 
 
422 aa  60.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  33.91 
 
 
491 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  24.89 
 
 
434 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  25.96 
 
 
528 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  50 
 
 
397 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  36.67 
 
 
356 aa  59.7  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  25.7 
 
 
273 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  28.93 
 
 
552 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  28.96 
 
 
571 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  28.44 
 
 
323 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  29.23 
 
 
330 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  26.85 
 
 
531 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  28.44 
 
 
323 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  36.75 
 
 
794 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  35.25 
 
 
560 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  32.57 
 
 
438 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  31.78 
 
 
325 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  47.95 
 
 
397 aa  58.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  34.55 
 
 
526 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  33.09 
 
 
747 aa  57.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  28.42 
 
 
447 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  28.42 
 
 
447 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>