171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1044 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  100 
 
 		 306 aa  620  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  96.41 
 
 		 306 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  60.47 
 
 		 305 aa  367  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  40.07 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  37.45 
 
 		 333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  38.89 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  34.81 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  35.07 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  34.17 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  34.81 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  35 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  35 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  37.04 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  30.04 
 
 		 453 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  29.9 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  29.9 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  30.18 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  29.06 
 
 		 512 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  25.75 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  30.42 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  27.83 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  29.11 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  26.57 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  28.68 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  29.23 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  24.27 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  29.69 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35493  predicted protein  24.46 
 
 		 450 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0224729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  25 
 
 		 591 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  30.22 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  28 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  29.92 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  27.48 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  24.26 
 
 		 568 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  25.69 
 
 		 677 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  29.52 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  34.42 
 
 		 1247 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  25.71 
 
 		 1077 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  26.28 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  29.91 
 
 		 472 aa  62.4  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  28 
 
 		 1147 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  28.84 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  26.76 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  26.43 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  27.17 
 
 		 629 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  24.06 
 
 		 476 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  26.78 
 
 		 584 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  37.84 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  26.42 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1913  peptidase M28  26.3 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  30.63 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  28.77 
 
 		 947 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  41.1 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  25.39 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  42.45 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  42.45 
 
 		 647 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  29.17 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  27.15 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  26.79 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  27.15 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  26.79 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  26.8 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  27.27 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  27.15 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  25.99 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  27.15 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  27.15 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  29.11 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  25.73 
 
 		 531 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  24.62 
 
 		 483 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  41.1 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.7 
 
 		 650 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  26.76 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  26.24 
 
 		 465 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  25.32 
 
 		 417 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  28.63 
 
 		 502 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  25.11 
 
 		 497 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  26.46 
 
 		 504 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  28.75 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  28.57 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  26.18 
 
 		 417 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  26.18 
 
 		 417 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  26.7 
 
 		 466 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  42.39 
 
 		 481 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  26.18 
 
 		 417 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  26.7 
 
 		 466 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  37.04 
 
 		 778 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  36.5 
 
 		 512 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  23.18 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  31.61 
 
 		 747 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  25.32 
 
 		 417 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  43.84 
 
 		 775 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  27.93 
 
 		 571 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  35.29 
 
 		 466 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  25.42 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  33.94 
 
 		 519 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  27.85 
 
 		 463 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  27.87 
 
 		 488 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  26.05 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  31.23 
 
 		 341 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>