263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4272 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  100 
 
 
552 aa  1118    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  48.54 
 
 
552 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  49.41 
 
 
539 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  47.93 
 
 
558 aa  458  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  46.82 
 
 
545 aa  455  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  45.72 
 
 
560 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  41.49 
 
 
551 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  33.57 
 
 
563 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  36.2 
 
 
529 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  38.21 
 
 
534 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  35.07 
 
 
550 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  33.59 
 
 
563 aa  244  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  31.57 
 
 
548 aa  233  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  32.37 
 
 
567 aa  233  9e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  34.22 
 
 
575 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  33.58 
 
 
549 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  32.38 
 
 
555 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  33.46 
 
 
549 aa  226  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  30.88 
 
 
547 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  32.97 
 
 
571 aa  225  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  31.3 
 
 
546 aa  220  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  33.03 
 
 
528 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  32.5 
 
 
550 aa  216  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  29.5 
 
 
552 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  32 
 
 
549 aa  211  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  32.45 
 
 
552 aa  210  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  32.45 
 
 
552 aa  209  7e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  32.42 
 
 
540 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  30.09 
 
 
557 aa  208  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  30.09 
 
 
557 aa  207  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  30.4 
 
 
597 aa  206  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  30.12 
 
 
539 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  32.43 
 
 
541 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  30.43 
 
 
557 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  31.84 
 
 
540 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  32.68 
 
 
537 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  32.43 
 
 
541 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  31.18 
 
 
529 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  32.06 
 
 
603 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  31.84 
 
 
540 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  31.84 
 
 
532 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  31.38 
 
 
506 aa  203  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  31.81 
 
 
542 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  32.42 
 
 
548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  31.32 
 
 
550 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  33.46 
 
 
506 aa  200  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  30.71 
 
 
559 aa  200  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  29.67 
 
 
558 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  30.45 
 
 
552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  32.34 
 
 
541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  32.39 
 
 
532 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  30.32 
 
 
551 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  30.56 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  31.35 
 
 
529 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  29.33 
 
 
558 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  31.24 
 
 
531 aa  196  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  30.39 
 
 
558 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  30.39 
 
 
558 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  29.9 
 
 
557 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  30 
 
 
556 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  31.91 
 
 
491 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  29.29 
 
 
569 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  31.05 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  31.04 
 
 
553 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  29.85 
 
 
528 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  30.62 
 
 
552 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  29.95 
 
 
546 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  31.03 
 
 
944 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.5 
 
 
579 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  26.56 
 
 
573 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  26.89 
 
 
573 aa  153  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.13 
 
 
598 aa  150  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  27.04 
 
 
533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  28.51 
 
 
506 aa  146  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  30.26 
 
 
503 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  28.97 
 
 
555 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.23 
 
 
623 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  26.5 
 
 
514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  32.71 
 
 
323 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  33.19 
 
 
674 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  34.27 
 
 
341 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  36.84 
 
 
325 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  31.33 
 
 
334 aa  106  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  30.38 
 
 
407 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  38.74 
 
 
394 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  35.78 
 
 
330 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  35.27 
 
 
315 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  35.53 
 
 
308 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  34.72 
 
 
490 aa  90.9  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  34.58 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  36.67 
 
 
301 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  32.62 
 
 
424 aa  87.4  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  34.44 
 
 
319 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  29.31 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  35.2 
 
 
1103 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.8 
 
 
574 aa  83.6  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  32.02 
 
 
319 aa  82.8  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  33.17 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.05 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  33.33 
 
 
346 aa  77  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>