181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2143 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  57.98 
 
 		 647 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 650 aa  1327    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  57.36 
 
 		 647 aa  751    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  35.36 
 
 		 347 aa  193  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0935  peptidase M28  36.26 
 
 		 345 aa  181  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2879  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  35.96 
 
 		 345 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3121  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  35.96 
 
 		 345 aa  178  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02603  aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion  35.96 
 
 		 345 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02568  hypothetical protein  35.96 
 
 		 345 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2891  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  35.96 
 
 		 345 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0959  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  35.96 
 
 		 345 aa  178  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4005  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  35.67 
 
 		 345 aa  177  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3054  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  35.67 
 
 		 345 aa  177  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.957011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  35.99 
 
 		 357 aa  175  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  36.12 
 
 		 1247 aa  174  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3246  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  34.5 
 
 		 348 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3061  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  34.5 
 
 		 348 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3126  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  34.5 
 
 		 348 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3142  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  34.5 
 
 		 348 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.634375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3087  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  34.5 
 
 		 348 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  28.19 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  28.19 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  28.19 
 
 		 656 aa  80.5  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  30 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 662 aa  73.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  31.21 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  39.42 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  39.68 
 
 		 518 aa  66.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.98 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  34.29 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  36.59 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  36.59 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  36.59 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  36.59 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  29.63 
 
 		 775 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  36.59 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  38.89 
 
 		 519 aa  63.9  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  33.71 
 
 		 457 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  40.2 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  33.83 
 
 		 465 aa  62  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  23.95 
 
 		 723 aa  61.6  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  39.08 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  39.08 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  34.96 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  34.96 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  30.43 
 
 		 1077 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  24.17 
 
 		 594 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  32.32 
 
 		 342 aa  59.7  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  31.55 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  26.86 
 
 		 684 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  35.65 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  27.78 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  39.08 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  28.67 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  36 
 
 		 515 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  31.13 
 
 		 1147 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  40.74 
 
 		 339 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  32.95 
 
 		 552 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  28.24 
 
 		 607 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  29.89 
 
 		 504 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  33.57 
 
 		 481 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  31.33 
 
 		 408 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  34.71 
 
 		 1131 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  30.77 
 
 		 523 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  31.62 
 
 		 512 aa  54.7  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  34.31 
 
 		 497 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  38.82 
 
 		 548 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  30.19 
 
 		 549 aa  54.3  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  29.38 
 
 		 309 aa  54.3  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  39.08 
 
 		 512 aa  54.3  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  28.47 
 
 		 490 aa  53.9  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  24.71 
 
 		 664 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  37.04 
 
 		 501 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  34.13 
 
 		 394 aa  53.9  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  37.04 
 
 		 501 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  37.04 
 
 		 501 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  40.4 
 
 		 330 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  38.89 
 
 		 677 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  31.69 
 
 		 510 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  28.28 
 
 		 501 aa  53.5  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  46.27 
 
 		 306 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  32.41 
 
 		 947 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  46.27 
 
 		 306 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  30 
 
 		 408 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  30.43 
 
 		 397 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  29.25 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  29.1 
 
 		 548 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  30 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  30 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  28.57 
 
 		 301 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  30 
 
 		 408 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  28.04 
 
 		 313 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  31.82 
 
 		 584 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  40 
 
 		 282 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  34.17 
 
 		 550 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  30 
 
 		 384 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  30 
 
 		 384 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  30 
 
 		 384 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  35.09 
 
 		 518 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  27.7 
 
 		 526 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>