95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0623 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  98.78 
 
 
656 aa  1323    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  100 
 
 
656 aa  1339    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  54.92 
 
 
662 aa  689    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  98.78 
 
 
656 aa  1324    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  98.15 
 
 
584 aa  1089    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  30.18 
 
 
630 aa  154  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.23 
 
 
617 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  25.54 
 
 
594 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  28.71 
 
 
646 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  23.28 
 
 
628 aa  125  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  28.47 
 
 
646 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  26.72 
 
 
629 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  26.43 
 
 
629 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  25.87 
 
 
629 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  25.41 
 
 
597 aa  106  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  27.65 
 
 
626 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  25.21 
 
 
597 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  27.66 
 
 
640 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  28.61 
 
 
636 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  26.75 
 
 
640 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  28.57 
 
 
268 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  24.96 
 
 
647 aa  91.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03398  hypothetical protein  32.24 
 
 
232 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4924  hypothetical protein  32.24 
 
 
232 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.335605  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03349  hypothetical protein  32.24 
 
 
232 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3978  hypothetical protein  31.58 
 
 
232 aa  87.4  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3869  hypothetical protein  32.24 
 
 
232 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4043  hypothetical protein  31.58 
 
 
232 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0168  putative lipase  31.58 
 
 
232 aa  87  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3750  hypothetical protein  31.58 
 
 
232 aa  87  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0164  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
232 aa  87  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  23.09 
 
 
628 aa  85.1  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3963  putative lipase  31.33 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0770687  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4024  putative lipase  31.33 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.266935  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3920  putative lipase  30.67 
 
 
234 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.65815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3836  putative lipase  30.67 
 
 
234 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.172505  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3855  putative lipase  30.67 
 
 
234 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.19 
 
 
650 aa  80.5  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0176  putative lipase  32.85 
 
 
234 aa  79.7  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.841932  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  24.27 
 
 
647 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  25.91 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  25.9 
 
 
319 aa  66.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.15 
 
 
375 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.6 
 
 
629 aa  65.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.93 
 
 
330 aa  65.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  23.68 
 
 
647 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.21 
 
 
418 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  26.83 
 
 
366 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  30.86 
 
 
310 aa  62.4  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  33.91 
 
 
339 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  26.27 
 
 
403 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25.41 
 
 
379 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  28.85 
 
 
379 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2010  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  25.41 
 
 
379 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.66526  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2621  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25.41 
 
 
379 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  28.85 
 
 
379 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  28.85 
 
 
379 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  28.85 
 
 
379 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  28.85 
 
 
379 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  28.85 
 
 
379 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  28.85 
 
 
379 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  27.52 
 
 
379 aa  57  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2668  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  24.6 
 
 
378 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.409429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  23.87 
 
 
341 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0053  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  27.93 
 
 
326 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.687588 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2541  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.35 
 
 
378 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23758  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  23.65 
 
 
658 aa  55.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  25.81 
 
 
309 aa  55.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  23.62 
 
 
610 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  23.62 
 
 
610 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  25.81 
 
 
309 aa  54.3  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  23.62 
 
 
610 aa  53.9  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  23.62 
 
 
610 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  23.62 
 
 
610 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  26.33 
 
 
320 aa  53.9  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  27.62 
 
 
372 aa  53.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  31.61 
 
 
337 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  33.14 
 
 
315 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  30.41 
 
 
316 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  23.36 
 
 
610 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  23.36 
 
 
610 aa  51.2  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  22.92 
 
 
1222 aa  50.4  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0696  putative lipase / esterase  28 
 
 
415 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.082644  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  31.71 
 
 
317 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  32.38 
 
 
340 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  27.18 
 
 
329 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  27.18 
 
 
329 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0978  GDSL family lipase  25 
 
 
377 aa  48.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2705  putative lipase / esterase protein  32.74 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3270  putative lipase / esterase  24.3 
 
 
416 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3287  lipolytic protein G-D-S-L family  27.98 
 
 
379 aa  47.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  31.1 
 
 
317 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  22.98 
 
 
763 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  25 
 
 
393 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  21.98 
 
 
607 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>