72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4652 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 664 aa  1324    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  58.65 
 
 		 684 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  60.26 
 
 		 684 aa  764    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  65.84 
 
 		 641 aa  824    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  43.85 
 
 		 723 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  36.84 
 
 		 607 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.91 
 
 		 629 aa  237  7e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  27.45 
 
 		 658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  28.61 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  28.61 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  28.61 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  28.35 
 
 		 610 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  28.35 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  28.61 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  26.37 
 
 		 610 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  28.35 
 
 		 627 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  23.88 
 
 		 630 aa  97.8  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  23.86 
 
 		 646 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  23.64 
 
 		 646 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  24.58 
 
 		 594 aa  87.8  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  23.29 
 
 		 629 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  23.97 
 
 		 629 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  24.24 
 
 		 636 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  23.56 
 
 		 629 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  24.87 
 
 		 626 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.55 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  23.4 
 
 		 640 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  29.8 
 
 		 1012 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  27.14 
 
 		 1222 aa  74.7  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  27.01 
 
 		 763 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  22.93 
 
 		 640 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.96 
 
 		 1673 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  28.14 
 
 		 759 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.87 
 
 		 617 aa  70.5  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  26.46 
 
 		 972 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  27.41 
 
 		 1672 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  29.57 
 
 		 1886 aa  68.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  21.79 
 
 		 597 aa  67.4  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.5 
 
 		 1489 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  24.9 
 
 		 1369 aa  65.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  28 
 
 		 1769 aa  64.3  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  23.44 
 
 		 1025 aa  60.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  24.55 
 
 		 939 aa  60.8  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  22.63 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  27 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  27.71 
 
 		 983 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  25.9 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  27.98 
 
 		 986 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  27.38 
 
 		 995 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  26.91 
 
 		 1068 aa  55.1  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  23.5 
 
 		 728 aa  54.3  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  23.5 
 
 		 728 aa  54.3  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  23.5 
 
 		 728 aa  54.3  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.71 
 
 		 650 aa  53.9  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.19 
 
 		 1179 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  26.15 
 
 		 1782 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  30.37 
 
 		 1056 aa  52.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  25.91 
 
 		 985 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  27.95 
 
 		 3506 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  27.59 
 
 		 1011 aa  51.2  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  25.15 
 
 		 488 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.75 
 
 		 1242 aa  51.2  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  23.72 
 
 		 647 aa  50.4  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  37.63 
 
 		 854 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  27.37 
 
 		 980 aa  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  27.14 
 
 		 816 aa  47.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  27.64 
 
 		 994 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  26.05 
 
 		 2848 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  21.05 
 
 		 662 aa  45.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.54 
 
 		 1134 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  28.47 
 
 		 2396 aa  44.3  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1214 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>