93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4161 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  100 
 
 
607 aa  1209    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.69 
 
 
629 aa  529  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  38.11 
 
 
723 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  37.46 
 
 
664 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.68 
 
 
641 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  33.84 
 
 
684 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  33.11 
 
 
684 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  30.11 
 
 
658 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  28.63 
 
 
627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.07 
 
 
610 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.07 
 
 
610 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  27.07 
 
 
610 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.07 
 
 
610 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  27.07 
 
 
610 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  26.88 
 
 
610 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  26.88 
 
 
610 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  27.67 
 
 
594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  25.87 
 
 
630 aa  94  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.53 
 
 
617 aa  84  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  28.98 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  28.98 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  27.36 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  27.48 
 
 
647 aa  70.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  26.74 
 
 
288 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.14 
 
 
1369 aa  68.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  23.38 
 
 
597 aa  68.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  22.59 
 
 
629 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  23.11 
 
 
662 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  22.74 
 
 
629 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5647  hypothetical protein  27.56 
 
 
307 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  26.32 
 
 
319 aa  64.7  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  23.16 
 
 
597 aa  64.3  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64990  hypothetical protein  27.21 
 
 
307 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.49 
 
 
1673 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  22.57 
 
 
626 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  27.07 
 
 
728 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.59 
 
 
650 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  27.07 
 
 
728 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  27.07 
 
 
728 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  26.42 
 
 
647 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.27 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.12 
 
 
1769 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  24.73 
 
 
628 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  26.94 
 
 
647 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  30.54 
 
 
1886 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  23.2 
 
 
646 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  25.09 
 
 
454 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  26.23 
 
 
337 aa  57.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  26.64 
 
 
1025 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  25.94 
 
 
309 aa  56.2  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.76 
 
 
330 aa  55.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  23.67 
 
 
636 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.85 
 
 
1489 aa  55.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
284 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.74 
 
 
418 aa  55.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  22.72 
 
 
646 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  25.6 
 
 
309 aa  55.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  21.86 
 
 
629 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1011  thermolabile hemolysin  23.73 
 
 
418 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.33 
 
 
774 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04871  lipolytic enzyme  23.83 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  23 
 
 
640 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  29.68 
 
 
628 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  23.62 
 
 
1222 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  25.57 
 
 
1214 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  24.77 
 
 
1782 aa  51.6  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  25.95 
 
 
1672 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  26.09 
 
 
317 aa  50.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  21.77 
 
 
656 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  22.32 
 
 
656 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  26.07 
 
 
320 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  24.16 
 
 
1012 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  24.16 
 
 
995 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  30 
 
 
1458 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.61 
 
 
1156 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  27.56 
 
 
268 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  28.31 
 
 
1154 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  22.1 
 
 
656 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  22.54 
 
 
640 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  25 
 
 
310 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  24.27 
 
 
972 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  29.72 
 
 
353 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.59 
 
 
1242 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  23.4 
 
 
759 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000776  thermolabile hemolysin precursor  22.75 
 
 
418 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  39.39 
 
 
854 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  22.16 
 
 
986 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  26.17 
 
 
1066 aa  44.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.64 
 
 
915 aa  44.3  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  25.59 
 
 
339 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  22.84 
 
 
763 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  25.1 
 
 
407 aa  44.3  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  25.42 
 
 
317 aa  44.3  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>