201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2188 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  100 
 
 		 490 aa  1008    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  36.15 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  53.71 
 
 		 319 aa  256  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  33.33 
 
 		 325 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  24.6 
 
 		 491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  35 
 
 		 541 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  35.97 
 
 		 540 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  35 
 
 		 541 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  35 
 
 		 541 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  35.18 
 
 		 540 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  34.75 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  35.18 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  34.78 
 
 		 540 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  34.11 
 
 		 528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  25.48 
 
 		 560 aa  117  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  34.78 
 
 		 506 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  34.29 
 
 		 529 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  35.02 
 
 		 529 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  38.21 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  38.17 
 
 		 552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  38.17 
 
 		 552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  32.41 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  30.48 
 
 		 539 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  32.24 
 
 		 551 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  33.2 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  29.88 
 
 		 552 aa  107  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  35.57 
 
 		 548 aa  106  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  34.09 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  32.94 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  37.7 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  37.43 
 
 		 549 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  34.9 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  31.65 
 
 		 546 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  35.56 
 
 		 556 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  26.61 
 
 		 555 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  31.1 
 
 		 550 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  34.25 
 
 		 548 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  24.9 
 
 		 503 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  35.36 
 
 		 552 aa  96.7  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  32.74 
 
 		 552 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  36.61 
 
 		 542 aa  95.9  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  34.43 
 
 		 550 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  35 
 
 		 569 aa  94.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.78 
 
 		 545 aa  94.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  22.38 
 
 		 528 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  29.25 
 
 		 534 aa  94.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  30.51 
 
 		 546 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  35.2 
 
 		 571 aa  93.6  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  33.17 
 
 		 550 aa  93.2  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  29.17 
 
 		 555 aa  93.2  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  34.81 
 
 		 552 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  33.33 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.87 
 
 		 674 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  32.78 
 
 		 553 aa  91.3  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  34.72 
 
 		 552 aa  90.9  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30.83 
 
 		 334 aa  90.9  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  27.67 
 
 		 563 aa  90.9  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  34.43 
 
 		 557 aa  90.1  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  32.18 
 
 		 575 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  31.31 
 
 		 563 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  34.43 
 
 		 558 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  31.28 
 
 		 529 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  34.44 
 
 		 558 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  34.44 
 
 		 558 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  32.77 
 
 		 559 aa  88.6  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  31.78 
 
 		 539 aa  87.8  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  30.61 
 
 		 551 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  33.52 
 
 		 558 aa  87.8  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  25.8 
 
 		 394 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  33.88 
 
 		 557 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  30.74 
 
 		 341 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  33.88 
 
 		 558 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  32.79 
 
 		 557 aa  87  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  27.69 
 
 		 342 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  23.18 
 
 		 944 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  40.94 
 
 		 623 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  27.1 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  33.33 
 
 		 557 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  31.05 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  30.33 
 
 		 1103 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  31.15 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  30.58 
 
 		 579 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.58 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  31.73 
 
 		 597 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  29.3 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  30.45 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  27.2 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30.13 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  30.3 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  38.52 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  28.83 
 
 		 301 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  28.23 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  29.38 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  26.02 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  36 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  24.65 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  28.76 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  29.55 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  30 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  30.09 
 
 		 333 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>