249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2825 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  100 
 
 		 539 aa  1080    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  50.85 
 
 		 558 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  49.41 
 
 		 552 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  45.14 
 
 		 552 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  44.16 
 
 		 545 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  38.38 
 
 		 551 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  40.04 
 
 		 560 aa  330  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  35.28 
 
 		 529 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  35.65 
 
 		 563 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  37.3 
 
 		 534 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  33.21 
 
 		 548 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  33.21 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  34.25 
 
 		 549 aa  217  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  32.88 
 
 		 506 aa  217  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  32.77 
 
 		 563 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  32.84 
 
 		 550 aa  213  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  32.44 
 
 		 567 aa  206  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  32.47 
 
 		 550 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  32.56 
 
 		 571 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  31.55 
 
 		 556 aa  202  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  32.44 
 
 		 555 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  31.54 
 
 		 549 aa  200  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  31.41 
 
 		 547 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  33.33 
 
 		 552 aa  199  9e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  31.5 
 
 		 569 aa  199  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  33.33 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  31.21 
 
 		 553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  31.57 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  31.53 
 
 		 548 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  31.98 
 
 		 552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  33.21 
 
 		 558 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  33.21 
 
 		 558 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  32.77 
 
 		 558 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  30.58 
 
 		 529 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  31.75 
 
 		 529 aa  193  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  33.46 
 
 		 558 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  32.18 
 
 		 522 aa  193  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.3 
 
 		 550 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  30.74 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  29.61 
 
 		 597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  32.63 
 
 		 557 aa  191  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  31.78 
 
 		 557 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  31.2 
 
 		 546 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  31.93 
 
 		 557 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  31.78 
 
 		 557 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  30.76 
 
 		 552 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  32.2 
 
 		 542 aa  186  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  30.38 
 
 		 541 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  29.81 
 
 		 491 aa  186  8e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  30.19 
 
 		 541 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  30.93 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  30.19 
 
 		 541 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  30.07 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  29.89 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  30.38 
 
 		 603 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  30.71 
 
 		 546 aa  183  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  29.89 
 
 		 540 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  29.89 
 
 		 532 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  30.31 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  30.31 
 
 		 551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  30.1 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  29.77 
 
 		 552 aa  180  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  29.29 
 
 		 549 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  31.09 
 
 		 559 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  28.39 
 
 		 531 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  31.85 
 
 		 563 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.51 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.11 
 
 		 579 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30.45 
 
 		 598 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  32.85 
 
 		 623 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  28.71 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  26.39 
 
 		 573 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.09 
 
 		 674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.05 
 
 		 533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  26.16 
 
 		 573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  28.85 
 
 		 514 aa  124  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  30.55 
 
 		 944 aa  123  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  29.09 
 
 		 506 aa  120  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  34.98 
 
 		 323 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  37.79 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30.8 
 
 		 334 aa  92.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  33 
 
 		 325 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  29.96 
 
 		 574 aa  88.6  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  31.78 
 
 		 490 aa  88.2  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  31.84 
 
 		 341 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  33.47 
 
 		 309 aa  87  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  24.33 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  32.96 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31.45 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  34.08 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  29.96 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.67 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  30.65 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  32.11 
 
 		 330 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  30.29 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.69 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  25.1 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  29.39 
 
 		 465 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  30.77 
 
 		 1103 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  24.57 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>