225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1031 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  100 
 
 		 563 aa  1152    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  50.94 
 
 		 571 aa  498  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  48.68 
 
 		 550 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  47.5 
 
 		 567 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  50.95 
 
 		 603 aa  488  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  48.02 
 
 		 551 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  45.93 
 
 		 555 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  46.68 
 
 		 549 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  45.59 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  46.83 
 
 		 546 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  44.4 
 
 		 552 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  46.41 
 
 		 548 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  46.4 
 
 		 548 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  44.53 
 
 		 549 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  45.25 
 
 		 552 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  43.95 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  43.95 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  43.95 
 
 		 532 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  43.64 
 
 		 557 aa  435  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  45.25 
 
 		 552 aa  435  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  44.36 
 
 		 532 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  44.59 
 
 		 506 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  43.27 
 
 		 557 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  43.09 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  42.06 
 
 		 575 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  42.99 
 
 		 558 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  42.99 
 
 		 558 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  44.59 
 
 		 541 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  44.79 
 
 		 541 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  44.66 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  42.99 
 
 		 558 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  44.79 
 
 		 541 aa  428  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  46.01 
 
 		 563 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  43.45 
 
 		 558 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  43.57 
 
 		 540 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  43.92 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  43.08 
 
 		 550 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  43.27 
 
 		 557 aa  425  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  44.7 
 
 		 529 aa  422  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  44.05 
 
 		 528 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  44.26 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  41.83 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  42.42 
 
 		 552 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  40.24 
 
 		 597 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  42.72 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  42.4 
 
 		 522 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  41.14 
 
 		 537 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  41.21 
 
 		 569 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  43.08 
 
 		 542 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  40.68 
 
 		 550 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  39.89 
 
 		 552 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  37.57 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  37.04 
 
 		 573 aa  365  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  35.82 
 
 		 563 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  33.66 
 
 		 552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  33.33 
 
 		 552 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  32.66 
 
 		 551 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  34.52 
 
 		 506 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  31.7 
 
 		 545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  32.77 
 
 		 539 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  32.63 
 
 		 529 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  31.25 
 
 		 560 aa  200  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  31.47 
 
 		 558 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  28.74 
 
 		 534 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.9 
 
 		 539 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  30.51 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.57 
 
 		 533 aa  167  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.35 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.23 
 
 		 546 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  28.74 
 
 		 514 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  27.86 
 
 		 579 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  30.99 
 
 		 531 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  28.49 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30.44 
 
 		 598 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  38.74 
 
 		 334 aa  128  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  25.71 
 
 		 674 aa  125  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.98 
 
 		 503 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  33.82 
 
 		 434 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  31.78 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  35.11 
 
 		 341 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  30.29 
 
 		 319 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.33 
 
 		 623 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.96 
 
 		 944 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  33.33 
 
 		 394 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  32.56 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  24.68 
 
 		 555 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  33.51 
 
 		 301 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  33.33 
 
 		 424 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  31.31 
 
 		 342 aa  90.1  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  27.17 
 
 		 318 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  32.84 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  25.81 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  29.65 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  31.13 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  31.08 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  32.93 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  31.31 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  31.94 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  37.7 
 
 		 1103 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  28.39 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>