243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0655 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  58.95 
 
 
549 aa  651    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  58.51 
 
 
552 aa  665    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  58.33 
 
 
552 aa  662    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  61.09 
 
 
549 aa  687    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  100 
 
 
550 aa  1111    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  61.63 
 
 
548 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  53.69 
 
 
575 aa  588  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  50.54 
 
 
550 aa  547  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  48.68 
 
 
563 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  49.25 
 
 
559 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  46.95 
 
 
567 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  48.02 
 
 
563 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  47.29 
 
 
571 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  43.94 
 
 
548 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  45.63 
 
 
551 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  44.55 
 
 
552 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  45.87 
 
 
603 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  43.57 
 
 
555 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  43.87 
 
 
546 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  41.58 
 
 
547 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  42.6 
 
 
532 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  42.24 
 
 
540 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  42.91 
 
 
542 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  42.42 
 
 
540 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  42.15 
 
 
553 aa  412  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  42.24 
 
 
540 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  42.07 
 
 
550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  42.19 
 
 
532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  41.7 
 
 
541 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  41.7 
 
 
541 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  41.34 
 
 
541 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  41.83 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  41.83 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  41.46 
 
 
522 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  40.39 
 
 
537 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  40.29 
 
 
558 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  42.12 
 
 
529 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  41.83 
 
 
558 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  41.07 
 
 
557 aa  398  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  42.4 
 
 
506 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  41.57 
 
 
557 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  41.39 
 
 
557 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  41.57 
 
 
557 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  40.91 
 
 
556 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  40.15 
 
 
552 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  41.5 
 
 
528 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  40.91 
 
 
569 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  40 
 
 
552 aa  389  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  39.89 
 
 
549 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  40.11 
 
 
597 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  40.55 
 
 
529 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  40.49 
 
 
563 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  36.7 
 
 
573 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  36.3 
 
 
573 aa  309  9e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  35.07 
 
 
552 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  32.97 
 
 
529 aa  236  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  31.83 
 
 
551 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  32.64 
 
 
552 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  30.67 
 
 
545 aa  220  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  32.08 
 
 
539 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  30.51 
 
 
560 aa  207  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  30.91 
 
 
506 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  30.02 
 
 
539 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  29.9 
 
 
506 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  31.08 
 
 
558 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  30.6 
 
 
531 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.92 
 
 
533 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  36.99 
 
 
534 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  29.08 
 
 
546 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.55 
 
 
491 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  29.8 
 
 
579 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.43 
 
 
528 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  27.78 
 
 
514 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.58 
 
 
598 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  30.25 
 
 
503 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  36.68 
 
 
334 aa  126  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  37.56 
 
 
341 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  40.59 
 
 
434 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  26.28 
 
 
555 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  37.5 
 
 
319 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.76 
 
 
944 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  36.42 
 
 
424 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.71 
 
 
674 aa  97.1  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  33.84 
 
 
309 aa  95.9  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  34.43 
 
 
490 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  35.47 
 
 
394 aa  94  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  32.54 
 
 
407 aa  93.6  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  34.03 
 
 
330 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  35.47 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.8 
 
 
318 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  31.02 
 
 
315 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.25 
 
 
346 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  30.69 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  28.33 
 
 
623 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  38.53 
 
 
319 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  38.74 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  35.15 
 
 
465 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  39.68 
 
 
1103 aa  76.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  34.98 
 
 
466 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  34.98 
 
 
466 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>