223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1846 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  89.5 
 
 
506 aa  950    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  98.33 
 
 
540 aa  1095    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  71.16 
 
 
549 aa  786    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  87.59 
 
 
541 aa  991    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  87.41 
 
 
541 aa  989    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  97.96 
 
 
540 aa  1090    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  69.94 
 
 
529 aa  767    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  98.5 
 
 
532 aa  1078    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  86.85 
 
 
541 aa  989    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  58.05 
 
 
537 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  71.32 
 
 
529 aa  768    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  100 
 
 
540 aa  1113    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  72.82 
 
 
528 aa  786    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  86.63 
 
 
532 aa  959    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  57.33 
 
 
550 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  47.08 
 
 
552 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  47.08 
 
 
551 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  47.46 
 
 
547 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  45.69 
 
 
555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  45.28 
 
 
546 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  43.57 
 
 
563 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  43.13 
 
 
558 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  43.13 
 
 
558 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  43.62 
 
 
558 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  43.41 
 
 
552 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  43.13 
 
 
558 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  40.59 
 
 
567 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  43.5 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  42.21 
 
 
569 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  43.11 
 
 
557 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  43.44 
 
 
552 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  43.3 
 
 
522 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  42.72 
 
 
557 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  42.72 
 
 
557 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  41.5 
 
 
597 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  42.57 
 
 
550 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  41.49 
 
 
556 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  41.9 
 
 
553 aa  405  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  41.7 
 
 
549 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  42.4 
 
 
571 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  42.59 
 
 
542 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  42.72 
 
 
603 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  43.77 
 
 
575 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  40 
 
 
548 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  41.23 
 
 
549 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  41.81 
 
 
550 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  40.33 
 
 
552 aa  363  4e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  40.15 
 
 
552 aa  360  4e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  39.16 
 
 
548 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  41.04 
 
 
563 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  37.83 
 
 
559 aa  333  6e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  34.46 
 
 
573 aa  294  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  34.53 
 
 
573 aa  289  7e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  33.4 
 
 
563 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  32.42 
 
 
552 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.12 
 
 
552 aa  207  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  28.84 
 
 
529 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  31.15 
 
 
551 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.44 
 
 
560 aa  190  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  30 
 
 
506 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  29.89 
 
 
539 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.64 
 
 
545 aa  174  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.61 
 
 
598 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.45 
 
 
539 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  29.42 
 
 
546 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  28.52 
 
 
558 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  28.29 
 
 
531 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  29.22 
 
 
506 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.29 
 
 
533 aa  146  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.18 
 
 
528 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  35.97 
 
 
490 aa  124  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  29.04 
 
 
514 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.57 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  33.33 
 
 
319 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  30.33 
 
 
623 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  31.2 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.64 
 
 
944 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  24.95 
 
 
579 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  31.79 
 
 
534 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  26.69 
 
 
503 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  31.34 
 
 
394 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30.58 
 
 
334 aa  96.7  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  22.98 
 
 
424 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  31.76 
 
 
341 aa  93.6  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  38 
 
 
309 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.11 
 
 
407 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.99 
 
 
674 aa  90.5  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31.46 
 
 
301 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  34.38 
 
 
315 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  23.87 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  33.82 
 
 
330 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.72 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  27.98 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  32.18 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  34.38 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  23.85 
 
 
555 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.87 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.47 
 
 
574 aa  73.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  31.25 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  31.78 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>