217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3003 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  100 
 
 		 558 aa  1118    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  50.64 
 
 		 539 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  48.18 
 
 		 552 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  45.02 
 
 		 552 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  43.92 
 
 		 545 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  42.08 
 
 		 560 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  39.89 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  35.71 
 
 		 529 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  36.35 
 
 		 534 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  32.02 
 
 		 563 aa  237  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  32.38 
 
 		 548 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  33.89 
 
 		 571 aa  220  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  34.8 
 
 		 506 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  31.66 
 
 		 563 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  33.77 
 
 		 575 aa  204  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  30.15 
 
 		 547 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  30.02 
 
 		 556 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.19 
 
 		 555 aa  200  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  30.51 
 
 		 542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  30.97 
 
 		 539 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  30.17 
 
 		 546 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  32.18 
 
 		 603 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  31.87 
 
 		 567 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.7 
 
 		 491 aa  195  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  31.45 
 
 		 549 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  32.66 
 
 		 551 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  30.09 
 
 		 553 aa  194  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  30.83 
 
 		 548 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  31.01 
 
 		 552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  29.21 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  30.41 
 
 		 549 aa  191  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  31.43 
 
 		 550 aa  190  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  30.61 
 
 		 552 aa  190  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  30.88 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  30.63 
 
 		 597 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  30.78 
 
 		 552 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  31.81 
 
 		 550 aa  187  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  32.59 
 
 		 563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  29.74 
 
 		 557 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  29.55 
 
 		 557 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  31.66 
 
 		 552 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.55 
 
 		 557 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  29.36 
 
 		 558 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  29.36 
 
 		 558 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  28.81 
 
 		 522 aa  177  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  29.03 
 
 		 558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.78 
 
 		 529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.99 
 
 		 558 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  28.86 
 
 		 528 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.57 
 
 		 557 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  30.6 
 
 		 546 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  28.28 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  28.32 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  29.75 
 
 		 559 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.15 
 
 		 541 aa  164  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  27.75 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.55 
 
 		 528 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  28.62 
 
 		 529 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.5 
 
 		 540 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  28.67 
 
 		 540 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  28.49 
 
 		 506 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  28.5 
 
 		 540 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  28.52 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  28.03 
 
 		 550 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  29.79 
 
 		 532 aa  157  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  29.49 
 
 		 531 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  27.38 
 
 		 573 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  27.33 
 
 		 573 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  30.06 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.52 
 
 		 579 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  26.87 
 
 		 537 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  27.71 
 
 		 514 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  32.36 
 
 		 623 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.29 
 
 		 598 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.94 
 
 		 944 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.98 
 
 		 503 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.7 
 
 		 533 aa  124  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  29.08 
 
 		 323 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  35.05 
 
 		 434 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  31.67 
 
 		 674 aa  99.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  32.86 
 
 		 490 aa  93.6  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  31.93 
 
 		 334 aa  93.2  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  34.24 
 
 		 319 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  29.1 
 
 		 574 aa  87.8  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.04 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  30.31 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  29.38 
 
 		 325 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  26.17 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30.74 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  26.83 
 
 		 555 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  27.53 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  25.05 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  29.82 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  29.36 
 
 		 330 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  32.41 
 
 		 318 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  31.86 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  25.64 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  31.6 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  34.21 
 
 		 1103 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  32.49 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>