271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0245 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02856  peptidase  75.27 
 
 		 575 aa  867    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  100 
 
 		 550 aa  1111    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  50.83 
 
 		 550 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  52.07 
 
 		 549 aa  525  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  52 
 
 		 552 aa  525  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  51.81 
 
 		 552 aa  521  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  50.57 
 
 		 548 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  49.72 
 
 		 549 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  48.5 
 
 		 559 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  46.96 
 
 		 563 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  40.76 
 
 		 552 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  43.08 
 
 		 563 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  39.66 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  39.71 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  42.78 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  45.16 
 
 		 603 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  41.38 
 
 		 552 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  43.68 
 
 		 571 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  42.22 
 
 		 558 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  42.96 
 
 		 548 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  42.22 
 
 		 558 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  43.44 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  41.72 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  41.63 
 
 		 558 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  42.02 
 
 		 522 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  41.44 
 
 		 558 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  42.11 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  41.72 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  42.3 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  40 
 
 		 552 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  41 
 
 		 529 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  38.18 
 
 		 537 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  41.21 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  41.68 
 
 		 553 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  39.77 
 
 		 567 aa  385  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  40.69 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  40.87 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  40.3 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  41.81 
 
 		 532 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  40.33 
 
 		 540 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  39.09 
 
 		 550 aa  379  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  38.88 
 
 		 546 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  40.8 
 
 		 532 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  41.81 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  40.73 
 
 		 541 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  41.81 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  40.23 
 
 		 528 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  39.66 
 
 		 597 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  40.55 
 
 		 529 aa  372  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  39.65 
 
 		 569 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  38.77 
 
 		 549 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  34.81 
 
 		 573 aa  310  5e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  34.23 
 
 		 573 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  35.05 
 
 		 563 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  31.14 
 
 		 552 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  31.75 
 
 		 506 aa  227  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  32.5 
 
 		 552 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.95 
 
 		 529 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  31.14 
 
 		 551 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  32.47 
 
 		 539 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.45 
 
 		 545 aa  199  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  31.72 
 
 		 558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  27.93 
 
 		 560 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  28.86 
 
 		 506 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.83 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.31 
 
 		 546 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.92 
 
 		 539 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.22 
 
 		 491 aa  144  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.35 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30.12 
 
 		 598 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.61 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.72 
 
 		 531 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  34.93 
 
 		 534 aa  133  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  30.12 
 
 		 503 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  31.82 
 
 		 514 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  30.55 
 
 		 944 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  35.14 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  38.17 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  28.96 
 
 		 334 aa  94  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  33.17 
 
 		 490 aa  93.2  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  31.82 
 
 		 341 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  32.98 
 
 		 623 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  41.03 
 
 		 674 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  26.12 
 
 		 555 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  27.23 
 
 		 394 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  31.41 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  24.27 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  30.26 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  30 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  32.61 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  32.61 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  27.04 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  35.16 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  29.02 
 
 		 318 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  39.29 
 
 		 1103 aa  72  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.7 
 
 		 487 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30.39 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  30.93 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.75 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  38.26 
 
 		 677 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>