207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1101 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  72.22 
 
 		 506 aa  772    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  71.88 
 
 		 540 aa  768    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  68.82 
 
 		 549 aa  723    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  71.84 
 
 		 541 aa  782    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  71.84 
 
 		 541 aa  780    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  67.68 
 
 		 529 aa  760    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  72.08 
 
 		 540 aa  768    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  71.46 
 
 		 541 aa  781    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  100 
 
 		 529 aa  1090    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  71.32 
 
 		 540 aa  768    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  71.04 
 
 		 528 aa  768    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  73.27 
 
 		 532 aa  777    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  72.08 
 
 		 532 aa  769    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  59.08 
 
 		 550 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  58.62 
 
 		 537 aa  615  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  48.04 
 
 		 551 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  44.51 
 
 		 552 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  45.38 
 
 		 547 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  44.27 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  45.17 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  44.7 
 
 		 558 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  43.91 
 
 		 552 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  44.4 
 
 		 558 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  44.32 
 
 		 557 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  44.21 
 
 		 558 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  44.21 
 
 		 558 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  44.7 
 
 		 563 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  43.74 
 
 		 557 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  43.35 
 
 		 557 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  43.35 
 
 		 557 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  43.66 
 
 		 542 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  42.83 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  43.16 
 
 		 548 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  42.45 
 
 		 567 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  42.36 
 
 		 556 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  45.01 
 
 		 571 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  42.16 
 
 		 597 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  42 
 
 		 552 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  42.33 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  44.15 
 
 		 603 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  41.86 
 
 		 546 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  41.91 
 
 		 549 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  42.31 
 
 		 575 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  40.55 
 
 		 550 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  39.59 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  41.09 
 
 		 550 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  39.96 
 
 		 552 aa  363  4e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  39.78 
 
 		 552 aa  359  7e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  40.19 
 
 		 548 aa  356  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  40.08 
 
 		 563 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  35.78 
 
 		 559 aa  320  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  33.33 
 
 		 573 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  32.83 
 
 		 573 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  35.39 
 
 		 563 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.89 
 
 		 529 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  31.56 
 
 		 552 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  31.75 
 
 		 539 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  31.08 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  31.43 
 
 		 551 aa  190  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  29.73 
 
 		 552 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.14 
 
 		 560 aa  169  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.2 
 
 		 545 aa  169  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.51 
 
 		 546 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  28.78 
 
 		 558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  28.22 
 
 		 531 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  27.54 
 
 		 514 aa  143  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.44 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  27.63 
 
 		 598 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  27.97 
 
 		 533 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.89 
 
 		 944 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.45 
 
 		 539 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  29 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  27.29 
 
 		 674 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.07 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  33.22 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  34.29 
 
 		 490 aa  117  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  31.76 
 
 		 623 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  32.61 
 
 		 319 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.27 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  25 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  30.16 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  32.67 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  31.75 
 
 		 334 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.62 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  31.91 
 
 		 341 aa  93.6  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.54 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  30.15 
 
 		 420 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31.43 
 
 		 301 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.49 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.5 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  32.34 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.21 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  32.07 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  34.12 
 
 		 308 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  25.18 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  30.7 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  38.39 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  28.14 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  27.96 
 
 		 555 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  35 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>