More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1459 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  100 
 
 
1103 aa  2254    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1386  peptidase M28  43.28 
 
 
736 aa  541  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000135431  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1115  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.19 
 
 
696 aa  349  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0348  peptidase, M1 family protein  31.31 
 
 
681 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620118  hitchhiker  0.0000015828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1761  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.65 
 
 
683 aa  318  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2487  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.17 
 
 
689 aa  317  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  30.67 
 
 
690 aa  313  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1636  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.8 
 
 
688 aa  308  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000915689  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.21 
 
 
702 aa  273  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1703  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.86 
 
 
717 aa  235  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.023595  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  35.59 
 
 
407 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1084  Aminopeptidase N-like protein  31.6 
 
 
658 aa  210  9e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  38.73 
 
 
674 aa  207  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1441  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.19 
 
 
661 aa  174  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  35.67 
 
 
598 aa  167  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  32.9 
 
 
555 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  38.02 
 
 
623 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  34.23 
 
 
944 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  37.16 
 
 
315 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  36.65 
 
 
330 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  36.43 
 
 
308 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  34.17 
 
 
574 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  31.86 
 
 
323 aa  125  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  32.28 
 
 
346 aa  107  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  37.14 
 
 
319 aa  104  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  31.03 
 
 
447 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  31.03 
 
 
447 aa  102  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  30.96 
 
 
533 aa  101  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  29.78 
 
 
322 aa  100  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  28.78 
 
 
334 aa  97.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  31.52 
 
 
309 aa  96.3  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.58 
 
 
504 aa  95.1  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  27.27 
 
 
591 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  29.93 
 
 
353 aa  93.2  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  30.36 
 
 
308 aa  92.8  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  30.77 
 
 
342 aa  92.8  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.37 
 
 
822 aa  92.8  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  26.49 
 
 
568 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4276  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.46 
 
 
828 aa  90.1  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0934597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.15 
 
 
546 aa  88.6  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  29.33 
 
 
352 aa  88.2  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.63 
 
 
845 aa  88.2  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  27.46 
 
 
341 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  28.62 
 
 
341 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  30.88 
 
 
764 aa  87  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  33.48 
 
 
335 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.23 
 
 
834 aa  86.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.16 
 
 
768 aa  85.9  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.9 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.82 
 
 
865 aa  85.1  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  30.89 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.32 
 
 
905 aa  84.7  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  30 
 
 
420 aa  84.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  28.91 
 
 
386 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  28.85 
 
 
424 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  35.2 
 
 
552 aa  84  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.85 
 
 
824 aa  82.8  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  29.25 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  29.11 
 
 
775 aa  83.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  30.33 
 
 
490 aa  82.4  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  29.81 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  25.94 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  28.57 
 
 
301 aa  82.4  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  33.12 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  28.91 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  32.69 
 
 
491 aa  81.6  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  29.97 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  21.43 
 
 
829 aa  81.3  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.51 
 
 
506 aa  80.1  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  31.28 
 
 
1247 aa  80.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.37 
 
 
835 aa  80.5  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  28.57 
 
 
384 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  43.48 
 
 
548 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  29.96 
 
 
528 aa  80.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  28.32 
 
 
341 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  33.03 
 
 
560 aa  79.7  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.63 
 
 
823 aa  79.7  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  36.79 
 
 
512 aa  79.7  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.5 
 
 
821 aa  78.2  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  30.33 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.56 
 
 
866 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  29.13 
 
 
579 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  35.8 
 
 
603 aa  77  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  39.68 
 
 
550 aa  76.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  42.61 
 
 
549 aa  76.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  31.34 
 
 
373 aa  76.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  42.98 
 
 
549 aa  75.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  42.15 
 
 
571 aa  75.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  30.08 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  28.99 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.7 
 
 
863 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  43.1 
 
 
545 aa  75.5  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.79 
 
 
822 aa  75.1  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  30.2 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  29.64 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2879  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  34.34 
 
 
345 aa  74.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  25.45 
 
 
430 aa  74.3  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  36.43 
 
 
563 aa  73.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  41.73 
 
 
552 aa  73.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0959  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  33.73 
 
 
345 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>