251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2521 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  100 
 
 		 551 aa  1119    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  57.03 
 
 		 546 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  50.09 
 
 		 547 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  51.07 
 
 		 552 aa  535  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  48.2 
 
 		 555 aa  537  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  50 
 
 		 567 aa  524  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  52.17 
 
 		 548 aa  525  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  48.98 
 
 		 563 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  49.64 
 
 		 603 aa  499  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  47.63 
 
 		 532 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  50 
 
 		 540 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  49.8 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  47.63 
 
 		 540 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  48.43 
 
 		 541 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  48.62 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  48.43 
 
 		 541 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  48.23 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  49.33 
 
 		 571 aa  491  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  48.62 
 
 		 532 aa  487  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  48.82 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  47.83 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  44.86 
 
 		 549 aa  475  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  45.66 
 
 		 550 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  46.05 
 
 		 529 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  46.65 
 
 		 558 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  46.65 
 
 		 558 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  43.45 
 
 		 557 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  43.01 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  44.1 
 
 		 558 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  43.92 
 
 		 558 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  42.46 
 
 		 537 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  43.64 
 
 		 557 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  45.54 
 
 		 550 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  43.27 
 
 		 557 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  43.27 
 
 		 557 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  45.47 
 
 		 542 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  44.9 
 
 		 569 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  45.28 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  43.53 
 
 		 556 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  43.78 
 
 		 575 aa  435  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  41.44 
 
 		 552 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  43.07 
 
 		 553 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  42.4 
 
 		 597 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  46.25 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  42.78 
 
 		 550 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  47.24 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  47.05 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  44.36 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  41.79 
 
 		 573 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  43.24 
 
 		 548 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  41.41 
 
 		 573 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  45.35 
 
 		 563 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  41.75 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  36.26 
 
 		 563 aa  346  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  31.55 
 
 		 552 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  33.58 
 
 		 551 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  30.27 
 
 		 545 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  31.36 
 
 		 529 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  30.96 
 
 		 552 aa  220  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  31.98 
 
 		 560 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  31.03 
 
 		 506 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  33.27 
 
 		 558 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  30.77 
 
 		 539 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  30.69 
 
 		 579 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.68 
 
 		 533 aa  177  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.28 
 
 		 598 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.73 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  28.97 
 
 		 531 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  29.45 
 
 		 528 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.91 
 
 		 491 aa  167  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  30.88 
 
 		 539 aa  163  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  38.31 
 
 		 534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  30.02 
 
 		 506 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  27.53 
 
 		 674 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  29.25 
 
 		 514 aa  147  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  28.69 
 
 		 503 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  35.48 
 
 		 334 aa  123  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  38.1 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  36.5 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  32.24 
 
 		 490 aa  112  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  30.49 
 
 		 319 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.42 
 
 		 623 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.14 
 
 		 944 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  32.39 
 
 		 394 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  33.51 
 
 		 315 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  30.61 
 
 		 319 aa  89  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  29.2 
 
 		 301 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  33.33 
 
 		 330 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  29.89 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  31.02 
 
 		 574 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.26 
 
 		 309 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  30.42 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.52 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  29.53 
 
 		 323 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  33.03 
 
 		 308 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  30.96 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  28.1 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  31.32 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  27.78 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  27.78 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>