More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3899 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  100 
 
 
674 aa  1371    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  38.18 
 
 
598 aa  324  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  39.64 
 
 
944 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  39.68 
 
 
407 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  40 
 
 
555 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  38.73 
 
 
1103 aa  207  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  40.22 
 
 
623 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  29.58 
 
 
528 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  29.01 
 
 
546 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  30.55 
 
 
531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  36.36 
 
 
574 aa  170  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.93 
 
 
533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  41.15 
 
 
330 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  30.84 
 
 
549 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  40.62 
 
 
315 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  27.29 
 
 
552 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  26.53 
 
 
542 aa  146  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  27.39 
 
 
551 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  40.09 
 
 
308 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  27.21 
 
 
569 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  35.06 
 
 
579 aa  140  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  26.4 
 
 
552 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  26.89 
 
 
529 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  27.21 
 
 
553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  26.89 
 
 
556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  27.73 
 
 
558 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  28.88 
 
 
548 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  26.37 
 
 
552 aa  135  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  26.27 
 
 
558 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  26.27 
 
 
558 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  26.27 
 
 
558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  39.23 
 
 
323 aa  131  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.03 
 
 
557 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  28.08 
 
 
557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  25.91 
 
 
548 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  28.09 
 
 
539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  26.84 
 
 
557 aa  129  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  34.02 
 
 
491 aa  129  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  37.07 
 
 
334 aa  129  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  27.29 
 
 
529 aa  128  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  28.08 
 
 
557 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  26.79 
 
 
522 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  25.93 
 
 
563 aa  124  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  26.45 
 
 
552 aa  120  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  25.13 
 
 
560 aa  120  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  33.33 
 
 
539 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  27.35 
 
 
603 aa  117  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  34.6 
 
 
341 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  34.07 
 
 
551 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  25.41 
 
 
597 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  25.55 
 
 
567 aa  114  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  31.67 
 
 
545 aa  111  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  40.88 
 
 
549 aa  110  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  33.19 
 
 
552 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  36.27 
 
 
424 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  39.44 
 
 
552 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  39.44 
 
 
552 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.24 
 
 
555 aa  107  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  34.72 
 
 
301 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  32.75 
 
 
503 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  33.33 
 
 
546 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  38.2 
 
 
571 aa  101  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  31.36 
 
 
529 aa  101  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  31.38 
 
 
534 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  24.75 
 
 
547 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  24.3 
 
 
549 aa  99.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  35.32 
 
 
391 aa  98.6  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  28.64 
 
 
318 aa  98.2  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  30.84 
 
 
342 aa  97.4  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  29.71 
 
 
550 aa  97.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  31.6 
 
 
506 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  40.32 
 
 
514 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  35.23 
 
 
420 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  32.48 
 
 
550 aa  95.1  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  31.98 
 
 
575 aa  94.4  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  25.18 
 
 
563 aa  94.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  29.44 
 
 
434 aa  94  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  28.14 
 
 
394 aa  92.8  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  29.75 
 
 
540 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  29.75 
 
 
540 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  29.75 
 
 
532 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  29.87 
 
 
490 aa  91.3  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  29.17 
 
 
537 aa  90.9  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  31.67 
 
 
528 aa  90.5  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.99 
 
 
540 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  31.06 
 
 
322 aa  89.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  30.62 
 
 
447 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  28.99 
 
 
541 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.99 
 
 
541 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  28.87 
 
 
532 aa  89.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  28.63 
 
 
422 aa  89.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  31.31 
 
 
309 aa  88.6  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  30.62 
 
 
447 aa  89  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  29.41 
 
 
319 aa  89  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  28.57 
 
 
541 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  29.73 
 
 
352 aa  87.4  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  30.67 
 
 
398 aa  87  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  28.57 
 
 
506 aa  87  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  30.67 
 
 
386 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  30.67 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>