239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1997 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  56.79 
 
 		 532 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  59.8 
 
 		 506 aa  646    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  58.43 
 
 		 540 aa  653    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  58.24 
 
 		 532 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  60.98 
 
 		 549 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  100 
 
 		 537 aa  1119    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  69.07 
 
 		 550 aa  755    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  60 
 
 		 541 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  60.2 
 
 		 541 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  60.2 
 
 		 541 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  58.43 
 
 		 540 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  58.05 
 
 		 540 aa  653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  60.04 
 
 		 528 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  58.33 
 
 		 529 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  58.62 
 
 		 529 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  43.22 
 
 		 552 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  43.82 
 
 		 547 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  42.31 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  42.1 
 
 		 551 aa  425  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  41.12 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  41.39 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  40.11 
 
 		 557 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  40.22 
 
 		 552 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  41.76 
 
 		 567 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  40.22 
 
 		 558 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  41.98 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  40.04 
 
 		 558 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  40.04 
 
 		 558 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  39.71 
 
 		 558 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  39.49 
 
 		 556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  40.68 
 
 		 569 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  41.58 
 
 		 557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  42.44 
 
 		 571 aa  405  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  41.24 
 
 		 563 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  41.58 
 
 		 557 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  41.78 
 
 		 557 aa  405  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  42.24 
 
 		 546 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  40 
 
 		 542 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  42.23 
 
 		 550 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  41.1 
 
 		 603 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  37.3 
 
 		 597 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  38.18 
 
 		 550 aa  385  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  37.61 
 
 		 575 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  38.01 
 
 		 548 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  38.37 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  38.83 
 
 		 549 aa  361  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  38.45 
 
 		 552 aa  347  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  38.25 
 
 		 552 aa  344  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  40.7 
 
 		 563 aa  343  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  36.7 
 
 		 548 aa  333  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  35.7 
 
 		 559 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  33.64 
 
 		 573 aa  289  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  34.01 
 
 		 563 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  33.27 
 
 		 573 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  32.68 
 
 		 552 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  28.52 
 
 		 529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  29.89 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  28.47 
 
 		 551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.11 
 
 		 560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.65 
 
 		 545 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  30.31 
 
 		 539 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  27.89 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.12 
 
 		 528 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.27 
 
 		 546 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.47 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.81 
 
 		 533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.69 
 
 		 598 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  26.2 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  28.12 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  26.69 
 
 		 558 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  26.79 
 
 		 531 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.66 
 
 		 491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  32.21 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  28.03 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  26.95 
 
 		 944 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  32.51 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  34.09 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  33.51 
 
 		 334 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  27.59 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  32.12 
 
 		 341 aa  100  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  30.74 
 
 		 319 aa  94  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.17 
 
 		 674 aa  90.9  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  31.72 
 
 		 394 aa  90.9  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  27.18 
 
 		 623 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  24.44 
 
 		 555 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.35 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.78 
 
 		 346 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.66 
 
 		 309 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  32.06 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  30.2 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  30.48 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  26.22 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  39.45 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  30.85 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  27.96 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  29.63 
 
 		 325 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  37.3 
 
 		 1103 aa  68.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  26.6 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  28.5 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  29.03 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>