221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2592 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  73.21 
 
 		 506 aa  782    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  72.22 
 
 		 532 aa  791    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  68.09 
 
 		 549 aa  755    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  72.22 
 
 		 540 aa  790    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  58.96 
 
 		 550 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  72.81 
 
 		 541 aa  797    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  72.62 
 
 		 541 aa  795    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  82.39 
 
 		 529 aa  922    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  71.84 
 
 		 540 aa  788    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  72.43 
 
 		 541 aa  796    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  70.34 
 
 		 529 aa  776    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  72.22 
 
 		 540 aa  790    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  100 
 
 		 528 aa  1092    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  71.26 
 
 		 532 aa  786    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  60.04 
 
 		 537 aa  633  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  45.71 
 
 		 552 aa  458  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  45.11 
 
 		 555 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  47.05 
 
 		 551 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  45.71 
 
 		 547 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  44.64 
 
 		 546 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  42.12 
 
 		 567 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  44.05 
 
 		 563 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  41.7 
 
 		 552 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  42.62 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  44.34 
 
 		 603 aa  415  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  42 
 
 		 558 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  42.15 
 
 		 557 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  43.02 
 
 		 522 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  43.6 
 
 		 558 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  42.56 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  43.38 
 
 		 542 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  43.6 
 
 		 558 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  41.87 
 
 		 557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  42.45 
 
 		 552 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  40.98 
 
 		 557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  41.6 
 
 		 548 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  41.38 
 
 		 569 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  43.26 
 
 		 571 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  40.86 
 
 		 597 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  41.04 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  41.37 
 
 		 550 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  40 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  40.44 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  39.93 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  40.23 
 
 		 550 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  40.65 
 
 		 575 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  39.78 
 
 		 552 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  39.59 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  39.23 
 
 		 548 aa  353  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  40.08 
 
 		 563 aa  347  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  35.43 
 
 		 559 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  34.82 
 
 		 573 aa  297  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  34.17 
 
 		 573 aa  291  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  34.88 
 
 		 563 aa  282  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  32.65 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  30.7 
 
 		 539 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  30.24 
 
 		 545 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  29.2 
 
 		 551 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  29.31 
 
 		 529 aa  183  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  28.78 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  29.01 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.02 
 
 		 560 aa  170  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  28.02 
 
 		 558 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30.2 
 
 		 598 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  28.79 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  30.23 
 
 		 506 aa  153  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.63 
 
 		 539 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  29.09 
 
 		 546 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.19 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  29.41 
 
 		 491 aa  130  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  28.51 
 
 		 528 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  24.6 
 
 		 579 aa  124  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  24.75 
 
 		 514 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  31.62 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  33.85 
 
 		 490 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.85 
 
 		 623 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  35.78 
 
 		 319 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  30.23 
 
 		 534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  26.57 
 
 		 944 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  25.95 
 
 		 503 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  31.43 
 
 		 334 aa  99.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  33.33 
 
 		 341 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.39 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  26.98 
 
 		 555 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  30.25 
 
 		 674 aa  90.5  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  30.83 
 
 		 407 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  25.85 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  33.33 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  25.48 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  32.37 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  35.78 
 
 		 309 aa  82.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  30.39 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  41.51 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  34.03 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  33.51 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.07 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  33.87 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  31.1 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  30.74 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  30.4 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>