270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02856 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  75.27 
 
 		 550 aa  867    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  100 
 
 		 575 aa  1170    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  54.63 
 
 		 550 aa  578  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  53.99 
 
 		 552 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  53.8 
 
 		 552 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  52.86 
 
 		 549 aa  548  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  53.44 
 
 		 549 aa  546  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  51.33 
 
 		 548 aa  525  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  48.5 
 
 		 559 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  46.2 
 
 		 563 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  40.79 
 
 		 552 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  43.38 
 
 		 563 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  42.05 
 
 		 547 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  41.98 
 
 		 555 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  43.5 
 
 		 551 aa  412  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  45.28 
 
 		 548 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  43.34 
 
 		 542 aa  412  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  44.32 
 
 		 571 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  42 
 
 		 557 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  40.94 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  42.11 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  40.62 
 
 		 557 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  42 
 
 		 557 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  41.81 
 
 		 557 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  42.26 
 
 		 558 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  41.87 
 
 		 558 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  42.26 
 
 		 558 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  41.68 
 
 		 558 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  41.39 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  45.12 
 
 		 603 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  41 
 
 		 556 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  39.75 
 
 		 553 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  40.27 
 
 		 546 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  40.26 
 
 		 552 aa  395  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  41.91 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  43.58 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  40.64 
 
 		 597 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  39.59 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  43.77 
 
 		 532 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  43.13 
 
 		 541 aa  389  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  43.77 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  43.77 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  42.55 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  42.75 
 
 		 541 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  42.75 
 
 		 541 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  37.61 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  40.54 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  42.31 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  43.5 
 
 		 532 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  40.65 
 
 		 528 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  39.89 
 
 		 549 aa  349  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  35.48 
 
 		 573 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  35.77 
 
 		 573 aa  313  5.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  35.44 
 
 		 563 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  33.39 
 
 		 551 aa  240  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  31 
 
 		 552 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  34.22 
 
 		 552 aa  231  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  32.07 
 
 		 506 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  33.21 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  31.57 
 
 		 529 aa  217  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.25 
 
 		 545 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  33.58 
 
 		 558 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  29.1 
 
 		 560 aa  173  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  29.48 
 
 		 506 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  26.61 
 
 		 491 aa  163  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  29.42 
 
 		 539 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.09 
 
 		 598 aa  160  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  29.67 
 
 		 531 aa  153  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.51 
 
 		 533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  34.82 
 
 		 534 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  28.85 
 
 		 514 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.42 
 
 		 546 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  25.92 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  29.72 
 
 		 503 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  27.35 
 
 		 579 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  30.18 
 
 		 944 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  37.97 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  31.8 
 
 		 334 aa  100  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  33.51 
 
 		 341 aa  97.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  31.98 
 
 		 674 aa  94.4  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  32.2 
 
 		 319 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  25.26 
 
 		 555 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  32.18 
 
 		 490 aa  89.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.2 
 
 		 394 aa  87.8  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.84 
 
 		 623 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  29.33 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  25.06 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  39.66 
 
 		 677 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.64 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  32.16 
 
 		 315 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  29.02 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  36.3 
 
 		 330 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  29.02 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.14 
 
 		 346 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.71 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30.53 
 
 		 309 aa  72.8  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30.53 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  31.25 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  31.25 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  31.18 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>