240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1252 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  100 
 
 		 434 aa  897    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  67.83 
 
 		 319 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  36.15 
 
 		 490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  40.83 
 
 		 325 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.33 
 
 		 491 aa  133  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  27.92 
 
 		 506 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  41.57 
 
 		 552 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  38.1 
 
 		 551 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  42.19 
 
 		 549 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  41.57 
 
 		 552 aa  119  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.93 
 
 		 503 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  31.62 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  35.22 
 
 		 539 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  40.59 
 
 		 550 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  31.2 
 
 		 540 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  31.6 
 
 		 540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  33.82 
 
 		 563 aa  113  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  31.6 
 
 		 532 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  40.59 
 
 		 545 aa  113  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  36.75 
 
 		 567 aa  113  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  34.38 
 
 		 546 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  30.8 
 
 		 540 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  30.33 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.1 
 
 		 550 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  30.61 
 
 		 541 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  30.61 
 
 		 541 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  29.76 
 
 		 506 aa  110  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  40 
 
 		 546 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  32.27 
 
 		 529 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  30.04 
 
 		 532 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  32.51 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  26.39 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  38.82 
 
 		 552 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  35.27 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  30.16 
 
 		 529 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  36.56 
 
 		 529 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  36.71 
 
 		 551 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  32.35 
 
 		 556 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  37.97 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  31.58 
 
 		 548 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  37.5 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  24.24 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  31.45 
 
 		 579 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  31.78 
 
 		 552 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  32.05 
 
 		 547 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  32.49 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  38.17 
 
 		 550 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  25.29 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  37.79 
 
 		 539 aa  97.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  37.78 
 
 		 560 aa  97.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  30.67 
 
 		 569 aa  97.1  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  33.69 
 
 		 603 aa  97.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  31.63 
 
 		 563 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  35.47 
 
 		 553 aa  96.7  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  30.4 
 
 		 522 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  31.78 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  34.88 
 
 		 552 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.44 
 
 		 674 aa  94  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  25.46 
 
 		 420 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  30.25 
 
 		 557 aa  93.2  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  32.86 
 
 		 531 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.83 
 
 		 557 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  29.83 
 
 		 557 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  32.22 
 
 		 557 aa  90.5  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  34.54 
 
 		 558 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  31.09 
 
 		 558 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  32.43 
 
 		 559 aa  90.1  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  32.47 
 
 		 548 aa  89.7  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.52 
 
 		 558 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.52 
 
 		 558 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  31.72 
 
 		 549 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  33.33 
 
 		 555 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  34.58 
 
 		 552 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  32.07 
 
 		 571 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  29.57 
 
 		 528 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  32.47 
 
 		 542 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.52 
 
 		 558 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  28.16 
 
 		 555 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  30.89 
 
 		 552 aa  87  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  35.62 
 
 		 597 aa  86.7  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  32.93 
 
 		 563 aa  86.7  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  42.2 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  41.44 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  28.26 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  40.43 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  29.08 
 
 		 574 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  28.34 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  26.74 
 
 		 573 aa  73.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30.67 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  26.29 
 
 		 308 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  35.16 
 
 		 1103 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  26.2 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  34.13 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  24.78 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  31.52 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  44.32 
 
 		 506 aa  66.2  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  21.19 
 
 		 323 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  35.51 
 
 		 625 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  30.26 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  27.49 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>