195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1839 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  73.16 
 
 		 522 aa  815    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  65.97 
 
 		 556 aa  788    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  100 
 
 		 597 aa  1243    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  70.61 
 
 		 558 aa  841    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  65.35 
 
 		 552 aa  800    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  69.22 
 
 		 557 aa  832    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  68.87 
 
 		 557 aa  831    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  71.43 
 
 		 552 aa  843    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  69.22 
 
 		 557 aa  831    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  68.49 
 
 		 542 aa  756    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  70.43 
 
 		 558 aa  842    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  70.78 
 
 		 558 aa  844    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  68.94 
 
 		 553 aa  825    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  69.57 
 
 		 557 aa  830    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  70.61 
 
 		 558 aa  841    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  68.59 
 
 		 569 aa  800    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  49.48 
 
 		 555 aa  566  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  48.25 
 
 		 552 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  46.64 
 
 		 547 aa  535  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  40.97 
 
 		 567 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  42.7 
 
 		 546 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  43.15 
 
 		 571 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  42.56 
 
 		 603 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  41.73 
 
 		 532 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  42.62 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  41.32 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  41.89 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  42.08 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  42.08 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  41.32 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  41.5 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  41.32 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  40.33 
 
 		 529 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  40.11 
 
 		 548 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  40.93 
 
 		 506 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  40.45 
 
 		 550 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  41.13 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  40.86 
 
 		 528 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  40.5 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  42.16 
 
 		 529 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  40.64 
 
 		 575 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  37.3 
 
 		 537 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  38.86 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  40.11 
 
 		 550 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  38.66 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  39.66 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  39 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  38.76 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  38.76 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  39.7 
 
 		 563 aa  360  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  39.03 
 
 		 548 aa  357  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  33.05 
 
 		 573 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  32.6 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  32.7 
 
 		 563 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.62 
 
 		 552 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  29.43 
 
 		 551 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  31.72 
 
 		 552 aa  206  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  29.08 
 
 		 529 aa  204  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  29.79 
 
 		 539 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.5 
 
 		 545 aa  187  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  27.55 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  30.39 
 
 		 558 aa  176  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  26.71 
 
 		 560 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30.95 
 
 		 598 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  26.63 
 
 		 539 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  29.69 
 
 		 534 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  27.62 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  28.54 
 
 		 531 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  25.43 
 
 		 491 aa  144  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.3 
 
 		 528 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  25.68 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  27.42 
 
 		 579 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  26.32 
 
 		 546 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  27.74 
 
 		 533 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.33 
 
 		 503 aa  124  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  25.41 
 
 		 674 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  38.62 
 
 		 341 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  26.36 
 
 		 944 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  33.69 
 
 		 334 aa  103  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  26.82 
 
 		 623 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  33.13 
 
 		 346 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  35.19 
 
 		 434 aa  87.4  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  32.69 
 
 		 490 aa  86.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  35.84 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  32.79 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  33.54 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  32.72 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  33.13 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  30.34 
 
 		 301 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  34.76 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  42.67 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  28.86 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  31.14 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  30.36 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  31.98 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  30.7 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  37.96 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  37.96 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  30.29 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  37.89 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>