231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0474 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  100 
 
 
422 aa  848    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  25.3 
 
 
424 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  29.6 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  31.16 
 
 
341 aa  94.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31.48 
 
 
301 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  35.39 
 
 
315 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  29.86 
 
 
531 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  31.11 
 
 
322 aa  90.1  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30.24 
 
 
309 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.63 
 
 
674 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  35.66 
 
 
529 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  32.85 
 
 
330 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  30.71 
 
 
533 aa  86.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  30.59 
 
 
318 aa  86.3  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  27.76 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  29.2 
 
 
546 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30.59 
 
 
334 aa  85.9  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  37.69 
 
 
558 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  40.57 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  32.09 
 
 
557 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  31.55 
 
 
558 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  31.55 
 
 
558 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  31.55 
 
 
558 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  32.42 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30 
 
 
598 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  31.02 
 
 
557 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  27.98 
 
 
540 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  33.7 
 
 
308 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  28.57 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  30.48 
 
 
557 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  27.57 
 
 
532 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.48 
 
 
555 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  27.57 
 
 
540 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  27.57 
 
 
540 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  31.25 
 
 
547 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  30.48 
 
 
557 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  34.03 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.03 
 
 
579 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  31.02 
 
 
553 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  28.68 
 
 
549 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  28.7 
 
 
341 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  27.08 
 
 
541 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  38.71 
 
 
552 aa  77.4  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  35.04 
 
 
569 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  38.71 
 
 
552 aa  77.4  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  27.08 
 
 
541 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  27.54 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  33.58 
 
 
555 aa  77.4  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  37.12 
 
 
563 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  28.04 
 
 
506 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  28.05 
 
 
541 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  29.95 
 
 
522 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  34.53 
 
 
552 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  25.44 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  34.75 
 
 
552 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  35.2 
 
 
514 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  34.53 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  34.53 
 
 
556 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  25.85 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  24.41 
 
 
506 aa  74.3  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  31.79 
 
 
546 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  25.31 
 
 
447 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  30.88 
 
 
552 aa  73.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  24.09 
 
 
528 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  25.06 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  35.59 
 
 
552 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  29.52 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  23.65 
 
 
944 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  32.48 
 
 
534 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  35.2 
 
 
549 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  43.96 
 
 
548 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  30.43 
 
 
571 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  28.83 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  27.51 
 
 
623 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  29.05 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  35.48 
 
 
549 aa  69.7  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  29.05 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  32.8 
 
 
603 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  29.05 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  26.23 
 
 
491 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  32.89 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  28.51 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  35.24 
 
 
560 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  28.14 
 
 
529 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  28.51 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  33.83 
 
 
537 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  40 
 
 
545 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  32.05 
 
 
551 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  34.38 
 
 
548 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  27.14 
 
 
1103 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  32.77 
 
 
567 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  28.38 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  32.71 
 
 
551 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  31.48 
 
 
597 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  30.14 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  40.22 
 
 
552 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  34.91 
 
 
539 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  40 
 
 
529 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  26.99 
 
 
347 aa  63.5  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2177  hypothetical protein  25.4 
 
 
695 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000333089  decreased coverage  1.74533e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>