222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3756 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  95.34 
 
 
393 aa  763    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  92.75 
 
 
384 aa  736    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  95.08 
 
 
398 aa  766    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  100 
 
 
386 aa  805    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  71.79 
 
 
346 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  67.96 
 
 
346 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  70.19 
 
 
346 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  68.75 
 
 
347 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  48.91 
 
 
353 aa  331  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  52.53 
 
 
342 aa  330  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  50.97 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  47.03 
 
 
352 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  47.1 
 
 
323 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  46.75 
 
 
322 aa  299  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  45.9 
 
 
341 aa  259  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  37.69 
 
 
309 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  34.05 
 
 
318 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  30.66 
 
 
319 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  34.52 
 
 
325 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31.31 
 
 
301 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30.19 
 
 
334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30.64 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  30.66 
 
 
407 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  26.3 
 
 
315 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.34 
 
 
574 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  30.87 
 
 
308 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  28.15 
 
 
330 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  33.91 
 
 
623 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  31.88 
 
 
555 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  31.49 
 
 
325 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  27.1 
 
 
341 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  28.05 
 
 
319 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.46 
 
 
944 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  30.67 
 
 
674 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.75 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  28.91 
 
 
1103 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  29.06 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  31.51 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.83 
 
 
533 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.37 
 
 
546 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  31.1 
 
 
503 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  28.16 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  32.68 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  28.28 
 
 
546 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  33.33 
 
 
552 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  34.17 
 
 
549 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.19 
 
 
579 aa  77  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.54 
 
 
531 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  30.45 
 
 
603 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  31.25 
 
 
569 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  29.68 
 
 
571 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  31.05 
 
 
557 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.41 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  30.53 
 
 
522 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  31.05 
 
 
555 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  31.28 
 
 
549 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  30.53 
 
 
557 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.24 
 
 
528 aa  73.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  31.05 
 
 
552 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  31.31 
 
 
558 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  32.81 
 
 
553 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  26.32 
 
 
548 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  30.53 
 
 
557 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  29.52 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  33.33 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  25.91 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  28.77 
 
 
548 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  32.24 
 
 
547 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  29.61 
 
 
552 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  27.27 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  30.81 
 
 
558 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  30.81 
 
 
558 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  28.76 
 
 
550 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  27.27 
 
 
447 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  29.8 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  26.6 
 
 
537 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.69 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  30.3 
 
 
558 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  30.39 
 
 
528 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  29.06 
 
 
552 aa  66.6  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  28.52 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  25.25 
 
 
563 aa  66.2  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  36.51 
 
 
490 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  31.44 
 
 
552 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  31.44 
 
 
552 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  31.58 
 
 
584 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30 
 
 
529 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.05 
 
 
550 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  33.85 
 
 
551 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  28.42 
 
 
542 aa  63.5  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  29.5 
 
 
551 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  31.6 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  28.8 
 
 
567 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.29 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  30.41 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  32.73 
 
 
1247 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  28.57 
 
 
529 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  30.41 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  30.41 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  32.62 
 
 
540 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>