225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0584 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  91.46 
 
 		 384 aa  743    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  100 
 
 		 398 aa  830    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  92.95 
 
 		 393 aa  764    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  95.08 
 
 		 386 aa  766    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  69.16 
 
 		 346 aa  481  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  71.2 
 
 		 346 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  69.94 
 
 		 346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  70 
 
 		 347 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  48.8 
 
 		 353 aa  333  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  52.34 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  50.97 
 
 		 341 aa  325  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  48.85 
 
 		 323 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  46.74 
 
 		 352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  47.06 
 
 		 322 aa  299  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  46.5 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  35.6 
 
 		 309 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  34.77 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  32.66 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  34.88 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  30.29 
 
 		 319 aa  140  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30.5 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  32.12 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30.98 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  26.38 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.34 
 
 		 574 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  32.75 
 
 		 555 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  28.15 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  28.82 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  33.91 
 
 		 623 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  29.73 
 
 		 308 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  31.33 
 
 		 325 aa  92.8  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  28.38 
 
 		 319 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  30.67 
 
 		 674 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.46 
 
 		 944 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.54 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.25 
 
 		 1103 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.75 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.25 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.85 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  32.68 
 
 		 598 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  33.33 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  33.04 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  30.91 
 
 		 603 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  27.8 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  31.1 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  30.14 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.45 
 
 		 579 aa  77  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  28.16 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  31.25 
 
 		 569 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.54 
 
 		 531 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.95 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  30.53 
 
 		 557 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  30 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  32.43 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.25 
 
 		 528 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.53 
 
 		 555 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  30.53 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  32.81 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  29.79 
 
 		 548 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  30 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  31.75 
 
 		 549 aa  72.8  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  33.33 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  26.92 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  30 
 
 		 557 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  30.3 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  32.79 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  26.51 
 
 		 548 aa  69.7  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  30.04 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  29.47 
 
 		 558 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.9 
 
 		 556 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  29.47 
 
 		 558 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  32.94 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  29.05 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  24.34 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  35.94 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.79 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  27.35 
 
 		 447 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  26.72 
 
 		 528 aa  67  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  27.35 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  29.29 
 
 		 558 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  32.54 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  30.6 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  32.76 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  32.76 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  35.71 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  27.93 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30 
 
 		 529 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  29.74 
 
 		 537 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  29.48 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.05 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  32.73 
 
 		 1247 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  29.9 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  29.9 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  29.9 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.17 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  32.42 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  28.26 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  29.9 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  31.58 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  26.5 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>