237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0567 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  100 
 
 		 322 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  50.81 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  48.97 
 
 		 353 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  49.4 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  50.77 
 
 		 346 aa  317  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  49.49 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  50.31 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  50 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  48.62 
 
 		 347 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  47.37 
 
 		 384 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  48.37 
 
 		 323 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  47.06 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  46.75 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  46.11 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  46.34 
 
 		 341 aa  277  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  35.29 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  36.13 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  33.1 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  30.65 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  31.23 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  28.57 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  29.81 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  26.36 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  32.25 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  34.53 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.78 
 
 		 1103 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  31.53 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  30.28 
 
 		 574 aa  99.4  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  29.37 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.5 
 
 		 424 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  33.05 
 
 		 533 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  30.3 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  32.89 
 
 		 555 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  33.33 
 
 		 598 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  30.67 
 
 		 422 aa  90.1  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  31.84 
 
 		 325 aa  89.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  31.06 
 
 		 674 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.75 
 
 		 546 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  32.38 
 
 		 623 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  30.5 
 
 		 420 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  32.04 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  32.99 
 
 		 579 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  29.81 
 
 		 528 aa  83.2  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  33.66 
 
 		 546 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  31.05 
 
 		 944 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  32.09 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  29.65 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  32.42 
 
 		 571 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  29.3 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  32.37 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  34.24 
 
 		 548 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  28.43 
 
 		 552 aa  77  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.02 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  28.57 
 
 		 531 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  30.57 
 
 		 603 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  31.1 
 
 		 528 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  25.73 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  29.95 
 
 		 569 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  26.56 
 
 		 557 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  25.81 
 
 		 558 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  25.81 
 
 		 558 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  34.62 
 
 		 549 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.42 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.19 
 
 		 557 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  25.31 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  27.86 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  29.26 
 
 		 552 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  26.37 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.25 
 
 		 556 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  29.66 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  27.66 
 
 		 522 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  26.17 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  26.88 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  29.57 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  24.55 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  32.43 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  28.22 
 
 		 552 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  36.14 
 
 		 552 aa  66.2  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  36.14 
 
 		 552 aa  66.2  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  33.53 
 
 		 571 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  27.14 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  27.55 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  32.49 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  25.56 
 
 		 616 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  25.75 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  30.11 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  30.11 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  30.11 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  28.7 
 
 		 549 aa  63.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  27.97 
 
 		 532 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  26.91 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.33 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  27.73 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  29.57 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  29.23 
 
 		 551 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  27.73 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  31.93 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  32.73 
 
 		 625 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  26.76 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  30.11 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>