148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2428 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  100 
 
 
273 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  95.96 
 
 
323 aa  541  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  95.96 
 
 
323 aa  541  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  50.19 
 
 
325 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  50.19 
 
 
325 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  48.69 
 
 
453 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  42.28 
 
 
321 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  40.82 
 
 
308 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  40.45 
 
 
347 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  41.95 
 
 
335 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  36.79 
 
 
299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  36.78 
 
 
282 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  35.56 
 
 
356 aa  139  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  33.22 
 
 
305 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  32.1 
 
 
333 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  35.96 
 
 
339 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  30.18 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  32.29 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  27.64 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  30.45 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  26.56 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.66 
 
 
555 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  27.73 
 
 
322 aa  62.4  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  27.78 
 
 
677 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  38.14 
 
 
455 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  26.46 
 
 
625 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  28.63 
 
 
342 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  29.6 
 
 
775 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  23.51 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  25.7 
 
 
512 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  36.52 
 
 
319 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  28.41 
 
 
568 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  27.27 
 
 
391 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  35.11 
 
 
436 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  28.16 
 
 
437 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  35.71 
 
 
501 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  29.12 
 
 
591 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  24.74 
 
 
1103 aa  57  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.7 
 
 
598 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  25.86 
 
 
674 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  26.17 
 
 
401 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  27.19 
 
 
330 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  25.7 
 
 
401 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  28 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  27.56 
 
 
384 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0019  hypothetical protein  31.13 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  25.14 
 
 
476 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  24.56 
 
 
407 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.27 
 
 
944 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  23.77 
 
 
465 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  37.97 
 
 
523 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  28 
 
 
398 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  33.96 
 
 
417 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  31.01 
 
 
408 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  25.54 
 
 
308 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  32.08 
 
 
417 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  30 
 
 
417 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  32.08 
 
 
417 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  27.56 
 
 
393 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  32.17 
 
 
514 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  25.83 
 
 
574 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  27.09 
 
 
539 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  30.77 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  31.01 
 
 
408 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  23.05 
 
 
466 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  23.05 
 
 
466 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2157  glutamine cyclotransferase-related protein  31.15 
 
 
333 aa  50.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  30.23 
 
 
408 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  30.23 
 
 
408 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  26.58 
 
 
341 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  33.68 
 
 
394 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  36.84 
 
 
323 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  30.23 
 
 
384 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  30.23 
 
 
384 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  30.23 
 
 
384 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  30.23 
 
 
384 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  31.48 
 
 
504 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  36.96 
 
 
417 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  29.13 
 
 
344 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  22.22 
 
 
466 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  26.89 
 
 
647 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  27.36 
 
 
647 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  23.87 
 
 
466 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  25.76 
 
 
353 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  31.43 
 
 
1147 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  34.29 
 
 
1077 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  34 
 
 
417 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  22.22 
 
 
466 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  32.53 
 
 
466 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  22.22 
 
 
466 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  42.37 
 
 
424 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0856  peptidase M28  36.11 
 
 
336 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  22.22 
 
 
466 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.58 
 
 
533 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  30 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  22.22 
 
 
466 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  27.62 
 
 
623 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  39.18 
 
 
764 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  28.83 
 
 
502 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  22.22 
 
 
466 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>