271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4102 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  100 
 
 		 420 aa  869    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  48.45 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  40.85 
 
 		 394 aa  315  7e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  35.53 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31.75 
 
 		 301 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  33.56 
 
 		 330 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  24.6 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  32.62 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  23.52 
 
 		 539 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  37.69 
 
 		 315 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  35.23 
 
 		 674 aa  96.3  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  31.55 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  25.17 
 
 		 552 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  24.88 
 
 		 552 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  28.09 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  27.85 
 
 		 447 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  32.76 
 
 		 308 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  26.17 
 
 		 555 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  25.46 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  43.22 
 
 		 346 aa  93.2  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  23.88 
 
 		 532 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  33.66 
 
 		 352 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  34.95 
 
 		 342 aa  90.9  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  34.04 
 
 		 549 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  30.15 
 
 		 529 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  35.47 
 
 		 550 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  34.44 
 
 		 529 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  23.87 
 
 		 540 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  30.5 
 
 		 322 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  23.38 
 
 		 541 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  24.67 
 
 		 506 aa  87.8  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  23.17 
 
 		 541 aa  87  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  24.88 
 
 		 506 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.65 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  25.48 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  30 
 
 		 1103 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  35.18 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  23.23 
 
 		 540 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  22.91 
 
 		 540 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  30.84 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  24.11 
 
 		 541 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  29.61 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  27.16 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  32.4 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  30.95 
 
 		 546 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  22.91 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  32.81 
 
 		 603 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  29.33 
 
 		 559 aa  80.9  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  31.51 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  31.07 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  32.13 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  25.81 
 
 		 563 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  33.33 
 
 		 571 aa  80.1  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  33.53 
 
 		 548 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  34.08 
 
 		 539 aa  79.7  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  33.69 
 
 		 545 aa  79.7  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  33.15 
 
 		 555 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  33.33 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  30.11 
 
 		 567 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  33.04 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  28.37 
 
 		 574 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  29.35 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  31.68 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  29.13 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  33.72 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.89 
 
 		 944 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  31.47 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  22.97 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  31.53 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  32.1 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  33.15 
 
 		 569 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  32.1 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  29.15 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  29.44 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.63 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  28.16 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  32.1 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  32.1 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  32.1 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  32.1 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  32.1 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  30.35 
 
 		 623 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  29 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  25.06 
 
 		 552 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.53 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  32.54 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.82 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  27.96 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  24.67 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  24.71 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  24.87 
 
 		 546 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  25.68 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  32.67 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  32.47 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  30.65 
 
 		 563 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  32.42 
 
 		 556 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  27 
 
 		 584 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  24.71 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  31.25 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  24.71 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>