226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2702 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  100 
 
 		 325 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.06 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  33.33 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  37.59 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  36.4 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  33.93 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  34.52 
 
 		 386 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  30.65 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  31.27 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  34.88 
 
 		 398 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  34.05 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  34.52 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  31.67 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  32.62 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  31.94 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  31.56 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  31.79 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  30.67 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  28.12 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  30.87 
 
 		 341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  29.77 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  31 
 
 		 579 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  27.87 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  31.31 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  33.33 
 
 		 546 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  33.33 
 
 		 557 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  44.25 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30.12 
 
 		 598 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  26.99 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  32.82 
 
 		 557 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  32.82 
 
 		 557 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  28.23 
 
 		 503 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  34.15 
 
 		 424 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  31.78 
 
 		 555 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  33.51 
 
 		 557 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  31.72 
 
 		 567 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  31.79 
 
 		 569 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  27.38 
 
 		 330 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  31.79 
 
 		 522 aa  85.9  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  34.9 
 
 		 552 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  32.47 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  33.16 
 
 		 553 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  31.08 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  32.85 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  32.5 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  32.47 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  32.47 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  32.47 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  26.9 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  32.11 
 
 		 571 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  31.07 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.61 
 
 		 533 aa  82.8  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  25 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  32.12 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.69 
 
 		 674 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  30.1 
 
 		 603 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  32.31 
 
 		 552 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  30.56 
 
 		 547 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  28.2 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  30.32 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  31.09 
 
 		 550 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  28.87 
 
 		 551 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  31.78 
 
 		 540 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  26.41 
 
 		 944 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  32 
 
 		 542 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  28.86 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  29.38 
 
 		 563 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  32.14 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  30.26 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  28.67 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  30.99 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  30.74 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  28.19 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  30.99 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  28.22 
 
 		 573 aa  73.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  30.99 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  27.84 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  28.22 
 
 		 573 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  32.74 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  30.33 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  29.11 
 
 		 552 aa  72.8  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  29.11 
 
 		 552 aa  72.8  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  30.89 
 
 		 548 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.52 
 
 		 550 aa  72.8  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.13 
 
 		 545 aa  72.8  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  25.91 
 
 		 549 aa  72.8  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  26.29 
 
 		 531 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  34.51 
 
 		 434 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.34 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.52 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.58 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  31.68 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  23.79 
 
 		 1103 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  31.68 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.83 
 
 		 528 aa  69.3  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  26.82 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  29.11 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  29.11 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  23.7 
 
 		 591 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  27.73 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>