278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3155 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  100 
 
 		 436 aa  887    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  32.63 
 
 		 625 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  30.86 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  36.22 
 
 		 466 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  34.63 
 
 		 457 aa  90.1  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  36.9 
 
 		 466 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  36.9 
 
 		 466 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  36.9 
 
 		 466 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  36.9 
 
 		 466 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  36.9 
 
 		 466 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  36.9 
 
 		 466 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  36.9 
 
 		 466 aa  87  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  35.83 
 
 		 465 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  36.36 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  36.36 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  31.67 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  30.54 
 
 		 584 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  32.56 
 
 		 1247 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  25.57 
 
 		 677 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  34.71 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  35.53 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  26.92 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  25.91 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  25.63 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  31.46 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  31.46 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  36.5 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  31.46 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  25.91 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  36.67 
 
 		 540 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  31.98 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  30.57 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  38.33 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  38.33 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  30.33 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  38.33 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.42 
 
 		 650 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  38.24 
 
 		 591 aa  66.6  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  29.44 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  33.14 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  44.58 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  29.44 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  27.14 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  30 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  34.13 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  28.02 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  41.07 
 
 		 1103 aa  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  36.13 
 
 		 528 aa  63.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  25.77 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  38.32 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  25.77 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  25.77 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  35.19 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  38.46 
 
 		 556 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  33.06 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  25.43 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  25.77 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  25.77 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  25.77 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.94 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  30.32 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  25.77 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  26.82 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  38.05 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  30.58 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.74 
 
 		 674 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  24.32 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  35.34 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  36.17 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  26.92 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  34.33 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  30.18 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  32.02 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  39.78 
 
 		 567 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  36.17 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  31.54 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  31.65 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  40.43 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  45.78 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  26.94 
 
 		 571 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  36.94 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  33.33 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  34.48 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  28.65 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  35.11 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  26.63 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  40.91 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  30.59 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  31.5 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  26.73 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  31.5 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  35.2 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  30.86 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  37.4 
 
 		 571 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  39.05 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  39.42 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  29.06 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  32.22 
 
 		 536 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  30.28 
 
 		 440 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  32.79 
 
 		 537 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>