234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_04290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  96.91 
 
 
647 aa  1266    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  57.98 
 
 
650 aa  761    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  100 
 
 
647 aa  1298    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  38.17 
 
 
347 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.282199 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0935  peptidase M28  38.05 
 
 
345 aa  200  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2879  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  38.05 
 
 
345 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02603  aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion  37.76 
 
 
345 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3121  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  37.76 
 
 
345 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0959  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  37.76 
 
 
345 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2891  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  37.76 
 
 
345 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02568  hypothetical protein  37.76 
 
 
345 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3054  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  37.46 
 
 
345 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.957011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4005  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  37.46 
 
 
345 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3142  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  37.06 
 
 
348 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.634375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3126  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  37.06 
 
 
348 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3087  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  37.06 
 
 
348 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3246  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  37.06 
 
 
348 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3061  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  37.06 
 
 
348 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  36.94 
 
 
357 aa  188  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  38.82 
 
 
1247 aa  177  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  33.05 
 
 
373 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  34.71 
 
 
775 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  31.82 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  28.77 
 
 
594 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  35.51 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  24.56 
 
 
656 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  24.56 
 
 
656 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  36.23 
 
 
465 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  36.23 
 
 
466 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16010  predicted aminopeptidase  26.12 
 
 
335 aa  72  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  hitchhiker  0.000000285922 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  36.23 
 
 
466 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  36.23 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  36.23 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  36.23 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  36.23 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  36.23 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  41.18 
 
 
548 aa  70.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  24.27 
 
 
656 aa  70.5  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  27.88 
 
 
662 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  37.78 
 
 
502 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  36.03 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  36.03 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  28.77 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  32.12 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  35.51 
 
 
519 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  37.01 
 
 
510 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  34.06 
 
 
518 aa  65.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  40.4 
 
 
339 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  42 
 
 
333 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  34 
 
 
512 aa  64.3  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  36.15 
 
 
625 aa  64.7  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  40.38 
 
 
440 aa  64.3  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  32.61 
 
 
457 aa  63.9  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  33.33 
 
 
1077 aa  63.9  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  31.97 
 
 
1147 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  37.39 
 
 
518 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  37.7 
 
 
502 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  34.44 
 
 
512 aa  63.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  32.43 
 
 
947 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  39.81 
 
 
512 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  25.49 
 
 
318 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  35.9 
 
 
584 aa  62.4  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  35.45 
 
 
515 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.38 
 
 
641 aa  61.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  32.79 
 
 
291 aa  60.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  33.64 
 
 
555 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.69 
 
 
598 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  39.09 
 
 
282 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  37.61 
 
 
450 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  25.9 
 
 
664 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  38.89 
 
 
500 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  36.59 
 
 
347 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  39.29 
 
 
1103 aa  58.9  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  26.82 
 
 
1369 aa  58.9  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  35.38 
 
 
512 aa  58.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  26.94 
 
 
607 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  31.87 
 
 
312 aa  58.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  35.03 
 
 
391 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  28.96 
 
 
597 aa  57.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  30.36 
 
 
356 aa  57.8  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  39.42 
 
 
436 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  36.94 
 
 
506 aa  57.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  25.58 
 
 
723 aa  57.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  28.96 
 
 
597 aa  57.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  35.82 
 
 
501 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  39.6 
 
 
513 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  35.82 
 
 
501 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  35.82 
 
 
501 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  32.45 
 
 
479 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  32.45 
 
 
479 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  32.45 
 
 
479 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  33.12 
 
 
342 aa  55.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  32.61 
 
 
1131 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  37.25 
 
 
488 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  32.39 
 
 
994 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  40.91 
 
 
417 aa  54.7  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  28.57 
 
 
533 aa  54.7  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  28.17 
 
 
313 aa  54.3  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  27.19 
 
 
309 aa  53.9  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  38.46 
 
 
417 aa  53.9  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>