147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1467 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  100 
 
 		 305 aa  621  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  60.81 
 
 		 306 aa  362  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  60.47 
 
 		 306 aa  358  6e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  38.79 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  37.84 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  37.8 
 
 		 339 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  35.86 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  35.74 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  35.4 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  35.02 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  31.39 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  31.39 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.387481 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  33.11 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  33.11 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  33.22 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  31.11 
 
 		 453 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  31.86 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  30.15 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  27.7 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  25.91 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  24.8 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  24.5 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  24.5 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  24.28 
 
 		 677 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  28.16 
 
 		 629 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  29.63 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  26.02 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  33.61 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  25.82 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  26.59 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  26.09 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  24.52 
 
 		 461 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  44.29 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  36.15 
 
 		 1247 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  25.65 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  45.83 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  25.65 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  25.65 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  25.65 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  25.65 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  25.22 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  26.06 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  27.24 
 
 		 523 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  28.7 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  24.46 
 
 		 468 aa  55.8  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1913  peptidase M28  27.21 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  26.27 
 
 		 584 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  25.88 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  28.57 
 
 		 436 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  24.34 
 
 		 478 aa  53.5  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  27.32 
 
 		 456 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  27.62 
 
 		 509 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  25.75 
 
 		 353 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  39.05 
 
 		 647 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  39.05 
 
 		 647 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  25 
 
 		 501 aa  52.8  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  38.24 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  38.24 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  38.24 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  38.24 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  41.57 
 
 		 775 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  38.24 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  24.35 
 
 		 417 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  38.24 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  24.35 
 
 		 417 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  38.24 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  38.24 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  24.26 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  27.62 
 
 		 568 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  30.33 
 
 		 1147 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  36.76 
 
 		 466 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  26.19 
 
 		 625 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  36.76 
 
 		 466 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  21.55 
 
 		 591 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  26.3 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02603  aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion  31.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0935  peptidase M28  31.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4005  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  23.48 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  27.64 
 
 		 437 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02568  hypothetical protein  31.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  25 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  36.76 
 
 		 466 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  29.51 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2891  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3054  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.957011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  30.33 
 
 		 1077 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0959  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2879  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  25.11 
 
 		 417 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3121  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  31.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  26.1 
 
 		 490 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  24.46 
 
 		 439 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  25.44 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  42.86 
 
 		 450 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  28.44 
 
 		 391 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  26.98 
 
 		 393 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  50 
 
 		 815 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  25.3 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  39.39 
 
 		 571 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>