185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3990 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  100 
 
 
447 aa  907    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  49.18 
 
 
456 aa  438  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  44.2 
 
 
454 aa  361  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  46.14 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  44.9 
 
 
436 aa  354  2e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  48.99 
 
 
438 aa  347  2e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  42.44 
 
 
440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  44.15 
 
 
454 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  42.01 
 
 
479 aa  302  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  41.55 
 
 
459 aa  293  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.72 
 
 
487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.05 
 
 
497 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  26.43 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  27.16 
 
 
473 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  27.64 
 
 
525 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  27.31 
 
 
495 aa  89.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  27.44 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  26.99 
 
 
472 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  27.62 
 
 
698 aa  80.5  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  28.83 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  26.65 
 
 
584 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  26.97 
 
 
512 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  28.47 
 
 
466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  24.82 
 
 
463 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  28.47 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  28.47 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  28.47 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  28.47 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  27.47 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  28.47 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  28.47 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  26.22 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  23.21 
 
 
598 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  24.5 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  27.74 
 
 
465 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  24.73 
 
 
571 aa  73.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  24.36 
 
 
526 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  24.6 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  30.23 
 
 
471 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  26.42 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  26.77 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  25.06 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  26.91 
 
 
539 aa  70.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  27.29 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  26.07 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  25.17 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  24.46 
 
 
580 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  25.68 
 
 
460 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  27.14 
 
 
468 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  26.13 
 
 
512 aa  67  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  26.43 
 
 
466 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  26.46 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  23.17 
 
 
545 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  25.28 
 
 
467 aa  65.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  27.95 
 
 
512 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  27.55 
 
 
512 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  26.67 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  29.15 
 
 
571 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  28.62 
 
 
534 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  27.18 
 
 
1077 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  30.13 
 
 
764 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  24.33 
 
 
457 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  28.4 
 
 
1147 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  24.72 
 
 
469 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  24.57 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.89 
 
 
346 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  29.61 
 
 
450 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  28.16 
 
 
574 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  23.15 
 
 
468 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  28.38 
 
 
391 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  24.09 
 
 
468 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  27.56 
 
 
510 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  22.84 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  26.92 
 
 
503 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  25.61 
 
 
471 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  27.15 
 
 
674 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  24.57 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  26.29 
 
 
775 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  31.78 
 
 
1103 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  22.67 
 
 
468 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  24.6 
 
 
531 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  28.12 
 
 
556 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  29.95 
 
 
558 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  24.05 
 
 
500 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  25.59 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  25 
 
 
509 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  25.24 
 
 
457 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  35.09 
 
 
548 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  27.23 
 
 
518 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  29.95 
 
 
558 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  29.95 
 
 
558 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  26.06 
 
 
506 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  26.41 
 
 
502 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  29.44 
 
 
558 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  25.39 
 
 
488 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  28.21 
 
 
437 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  24.09 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  29.23 
 
 
603 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  30.56 
 
 
759 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  30.3 
 
 
532 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>