173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3368 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  100 
 
 
459 aa  921    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  69.62 
 
 
454 aa  635    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  56.34 
 
 
479 aa  478  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  44.77 
 
 
440 aa  325  1e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  41.43 
 
 
440 aa  324  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  40.13 
 
 
456 aa  312  6.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  41.65 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  40.9 
 
 
436 aa  296  7e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  41.55 
 
 
447 aa  293  4e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  38.63 
 
 
454 aa  279  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.29 
 
 
497 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.56 
 
 
487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  25.49 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  25.93 
 
 
525 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  24.13 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  28.16 
 
 
526 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  24.08 
 
 
462 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  25.51 
 
 
471 aa  73.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  26.33 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  27.42 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  25.85 
 
 
512 aa  69.7  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  29.78 
 
 
548 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  26.9 
 
 
471 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  32.75 
 
 
603 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  25.34 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  23.03 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  27.06 
 
 
512 aa  66.6  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  24.61 
 
 
471 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  28.8 
 
 
571 aa  63.9  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  24.32 
 
 
458 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  24.78 
 
 
495 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  28.42 
 
 
555 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  23.03 
 
 
598 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  24.05 
 
 
500 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  31.69 
 
 
549 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  24.34 
 
 
468 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  25.37 
 
 
481 aa  60.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  31.02 
 
 
551 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  28.57 
 
 
563 aa  60.5  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  25.98 
 
 
512 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  24.25 
 
 
466 aa  60.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  26.61 
 
 
547 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.07 
 
 
674 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  24.17 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  23.31 
 
 
468 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  25.08 
 
 
580 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  24.07 
 
 
454 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  24.32 
 
 
571 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.67 
 
 
346 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  25.98 
 
 
551 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  23.21 
 
 
477 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  26.57 
 
 
546 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  27.27 
 
 
420 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  28.15 
 
 
534 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  32.69 
 
 
549 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  22.18 
 
 
552 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  23.74 
 
 
467 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  23.75 
 
 
463 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  26.27 
 
 
558 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  24.95 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  25.39 
 
 
468 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  27.66 
 
 
540 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  21.74 
 
 
472 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  26.67 
 
 
775 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  24.06 
 
 
469 aa  54.7  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  24.56 
 
 
539 aa  54.3  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  27.97 
 
 
457 aa  54.3  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  25 
 
 
416 aa  54.3  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  26.7 
 
 
550 aa  53.9  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  26.07 
 
 
510 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  21.32 
 
 
698 aa  53.9  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  23.82 
 
 
515 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  25.4 
 
 
541 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  25.4 
 
 
541 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  25.93 
 
 
541 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  27.13 
 
 
540 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  27.13 
 
 
540 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  27.13 
 
 
532 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  25.4 
 
 
506 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  30.69 
 
 
550 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  32.58 
 
 
567 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  26.46 
 
 
532 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  25.82 
 
 
518 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  26.83 
 
 
503 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0931  aminopeptidase  29.24 
 
 
539 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0562565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  29.94 
 
 
542 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  23.08 
 
 
468 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  25.16 
 
 
545 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  27.23 
 
 
548 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  25.85 
 
 
502 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  24.94 
 
 
468 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  25.47 
 
 
552 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  28.66 
 
 
574 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  26.46 
 
 
528 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  27.42 
 
 
573 aa  50.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  24.07 
 
 
1247 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  27.56 
 
 
319 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  26.78 
 
 
468 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  27.51 
 
 
529 aa  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  28.85 
 
 
625 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>