285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4476 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  98.32 
 
 
417 aa  839    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  91.85 
 
 
417 aa  795    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  91.59 
 
 
417 aa  788    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  92.07 
 
 
417 aa  773    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
417 aa  851    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  92.07 
 
 
417 aa  773    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  71.53 
 
 
408 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  71.53 
 
 
408 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  71.29 
 
 
408 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  71.05 
 
 
408 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  72.56 
 
 
384 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  72.31 
 
 
384 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  72.31 
 
 
384 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  72.31 
 
 
384 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  45.7 
 
 
501 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  45.27 
 
 
523 aa  322  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  45.21 
 
 
677 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  45.87 
 
 
504 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  42.6 
 
 
483 aa  244  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  37.07 
 
 
401 aa  196  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  37.07 
 
 
401 aa  196  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  33.02 
 
 
397 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  33.23 
 
 
397 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  37.5 
 
 
407 aa  172  7.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04080  peptidase, putative  33.8 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1158  hypothetical protein  31.68 
 
 
398 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1163  hypothetical protein  30.77 
 
 
398 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  36.71 
 
 
390 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02780  aminopeptidase, putative  30.15 
 
 
516 aa  82.4  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  29.5 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  26.24 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  30.88 
 
 
526 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  28.81 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  32.81 
 
 
560 aa  69.7  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  27.59 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  29.41 
 
 
551 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  37.93 
 
 
525 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  26.96 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  28.85 
 
 
459 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  32 
 
 
557 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  43.68 
 
 
539 aa  67  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  32.98 
 
 
469 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  27.76 
 
 
629 aa  66.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  32.94 
 
 
674 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  35.4 
 
 
497 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  31.84 
 
 
522 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  30.14 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  31.34 
 
 
557 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  31.34 
 
 
557 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  31.34 
 
 
557 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  26.64 
 
 
584 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  31.41 
 
 
467 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  28.5 
 
 
509 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  29.67 
 
 
468 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  31.22 
 
 
525 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  28.1 
 
 
461 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  31.56 
 
 
623 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  26.61 
 
 
315 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  31.5 
 
 
558 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  29.27 
 
 
420 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  27.4 
 
 
947 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  30.11 
 
 
552 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  26.42 
 
 
598 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.98 
 
 
552 aa  61.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  26.57 
 
 
458 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  42.7 
 
 
481 aa  60.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  28.7 
 
 
472 aa  59.7  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  32 
 
 
478 aa  59.7  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  30.66 
 
 
347 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  31.22 
 
 
495 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  28.11 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  28.57 
 
 
334 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  26.67 
 
 
502 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  35.09 
 
 
487 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  30.93 
 
 
468 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  28.5 
 
 
539 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  33.17 
 
 
471 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  34.26 
 
 
552 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  31 
 
 
558 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  28.57 
 
 
1103 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  30.89 
 
 
468 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  28.19 
 
 
313 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  30.06 
 
 
466 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  35.29 
 
 
472 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  29.9 
 
 
386 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  29.82 
 
 
571 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  28.87 
 
 
398 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  30.46 
 
 
468 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30.16 
 
 
323 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  25.7 
 
 
407 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  37.37 
 
 
333 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  30.5 
 
 
558 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  27.4 
 
 
434 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  30.5 
 
 
558 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  29.41 
 
 
550 aa  56.6  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  30.46 
 
 
468 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  29.71 
 
 
542 aa  56.6  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  28.8 
 
 
472 aa  56.6  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  30.23 
 
 
312 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  30.97 
 
 
512 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>