235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4339 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  100 
 
 		 815 aa  1578    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  46.94 
 
 		 616 aa  270  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  40.4 
 
 		 794 aa  210  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5347  peptidase M28  31.05 
 
 		 772 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  36.05 
 
 		 799 aa  187  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  29.55 
 
 		 783 aa  184  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  39.78 
 
 		 747 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  40.38 
 
 		 778 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46351  predicted protein  27.42 
 
 		 937 aa  90.9  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0158707 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10522  Peptidase family M28 family (AFU_orthologue; AFUA_1G05960)  25.46 
 
 		 953 aa  77  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264533  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  31.1 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  30.16 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  41.35 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  30.8 
 
 		 525 aa  70.1  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  30.52 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  26.25 
 
 		 775 aa  68.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  39.85 
 
 		 603 aa  67.8  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  41.05 
 
 		 506 aa  67.4  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  34.75 
 
 		 557 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00550  expressed protein  24.42 
 
 		 898 aa  66.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  34.75 
 
 		 557 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  42.16 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  35.04 
 
 		 557 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  35.25 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  35.25 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  34.75 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  34.75 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  34.53 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  44.09 
 
 		 514 aa  64.3  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  30.61 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  37.78 
 
 		 571 aa  63.9  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  31.84 
 
 		 549 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  33.33 
 
 		 563 aa  62  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  36.13 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  26.11 
 
 		 574 aa  61.2  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  39.42 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  34.35 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  33.88 
 
 		 553 aa  60.1  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  32.62 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  40.96 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  25.66 
 
 		 1103 aa  60.1  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  37.59 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  32.69 
 
 		 550 aa  60.1  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  40.91 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  28.57 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  32.87 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  27.93 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  32.52 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  31.22 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  30.38 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  34.09 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  27.03 
 
 		 674 aa  58.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  34.09 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  32.82 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  42.05 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  35.78 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  40.4 
 
 		 325 aa  57.4  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  34.86 
 
 		 579 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  32.82 
 
 		 556 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  33.88 
 
 		 757 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  29.38 
 
 		 552 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  39.25 
 
 		 539 aa  56.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  25.37 
 
 		 430 aa  56.6  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.15 
 
 		 598 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  28.5 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  28.73 
 
 		 512 aa  56.6  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  30.74 
 
 		 338 aa  56.6  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  25.94 
 
 		 334 aa  56.2  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  26.9 
 
 		 526 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  26.6 
 
 		 424 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  36.05 
 
 		 325 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  26.64 
 
 		 512 aa  55.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  33.06 
 
 		 342 aa  55.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  35.11 
 
 		 546 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  31.78 
 
 		 552 aa  55.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009370  OSTLU_18580  predicted protein  26.34 
 
 		 877 aa  54.7  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000566018  normal  0.0108768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  37.25 
 
 		 751 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  36.19 
 
 		 551 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  40.7 
 
 		 450 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  36.79 
 
 		 551 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  32.69 
 
 		 552 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  25.52 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  39.53 
 
 		 308 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  31.88 
 
 		 552 aa  53.5  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  33.1 
 
 		 625 aa  53.5  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  33.33 
 
 		 346 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  33.94 
 
 		 555 aa  53.5  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  35.9 
 
 		 341 aa  53.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  37.63 
 
 		 563 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  31.43 
 
 		 550 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  28.07 
 
 		 447 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  31.19 
 
 		 491 aa  53.5  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1835  peptidase M28  30.77 
 
 		 315 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  28.69 
 
 		 422 aa  52.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  31.47 
 
 		 372 aa  52.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30 
 
 		 323 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  31.47 
 
 		 398 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  28.07 
 
 		 447 aa  52.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  31.62 
 
 		 375 aa  52.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  33.33 
 
 		 533 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>