91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0871 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  45.99 
 
 
783 aa  668    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  100 
 
 
799 aa  1630    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  28.53 
 
 
794 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  33.61 
 
 
771 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5347  peptidase M28  27.86 
 
 
772 aa  194  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  36.47 
 
 
815 aa  184  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  33.9 
 
 
747 aa  160  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  36.88 
 
 
616 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  33.07 
 
 
778 aa  114  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46351  predicted protein  25.33 
 
 
937 aa  103  9e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0158707 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10522  Peptidase family M28 family (AFU_orthologue; AFUA_1G05960)  24.9 
 
 
953 aa  89.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264533  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18580  predicted protein  26.61 
 
 
877 aa  71.2  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000566018  normal  0.0108768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  24.4 
 
 
775 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  28.81 
 
 
1247 aa  66.6  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  32.05 
 
 
319 aa  65.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00550  expressed protein  27.27 
 
 
898 aa  65.1  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  28.19 
 
 
318 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.93 
 
 
309 aa  60.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  24.14 
 
 
488 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  24.23 
 
 
501 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  24.23 
 
 
501 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  24.23 
 
 
501 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  23.83 
 
 
488 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  45 
 
 
333 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  31.11 
 
 
344 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  30.4 
 
 
479 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  30.4 
 
 
479 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  30.4 
 
 
479 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  31.09 
 
 
343 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  38.38 
 
 
339 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  40.23 
 
 
391 aa  53.9  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  23.9 
 
 
502 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  34.11 
 
 
550 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  33.33 
 
 
514 aa  52.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0856  peptidase M28  24.81 
 
 
336 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  24.23 
 
 
500 aa  52  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  36.96 
 
 
552 aa  52  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  31.85 
 
 
506 aa  51.2  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  34.78 
 
 
370 aa  50.8  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  33.33 
 
 
308 aa  50.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  26.81 
 
 
559 aa  48.9  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  23.51 
 
 
510 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  27.93 
 
 
1077 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  39.74 
 
 
335 aa  48.9  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  28.47 
 
 
433 aa  48.9  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  30.88 
 
 
373 aa  48.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  32.14 
 
 
526 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  29.93 
 
 
432 aa  47.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  30.43 
 
 
420 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  34.62 
 
 
301 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  31.15 
 
 
552 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  30 
 
 
579 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.45 
 
 
503 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  32.28 
 
 
389 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  27.74 
 
 
550 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  42.05 
 
 
466 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  40.62 
 
 
466 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  30.77 
 
 
574 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  42.05 
 
 
466 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  40.62 
 
 
466 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  27.65 
 
 
372 aa  46.6  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  33.98 
 
 
551 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  37.35 
 
 
455 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  30.88 
 
 
512 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  26.89 
 
 
440 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  31.71 
 
 
525 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  31.15 
 
 
552 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  42.05 
 
 
466 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  42.05 
 
 
466 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  42.05 
 
 
466 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  42.05 
 
 
466 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  33.33 
 
 
677 aa  46.2  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  28.78 
 
 
575 aa  45.8  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  31.63 
 
 
549 aa  45.8  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  27.93 
 
 
346 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  30.33 
 
 
549 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  30.19 
 
 
502 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  42.05 
 
 
466 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2430  peptidase M28  35.14 
 
 
394 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611176 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  30.07 
 
 
368 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  30 
 
 
312 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  39.71 
 
 
342 aa  45.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  30.77 
 
 
430 aa  45.4  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  26.89 
 
 
313 aa  45.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  42.53 
 
 
465 aa  45.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  40.45 
 
 
466 aa  44.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  26.37 
 
 
322 aa  44.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  33.65 
 
 
447 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  23.44 
 
 
442 aa  44.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  34.58 
 
 
548 aa  44.3  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  33.33 
 
 
447 aa  44.3  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>